More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0389 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0389  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  91.28 
 
 		 283 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 		 264 aa  141  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7064  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.282667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0140  short chain dehydrogenase  32.57 
 
 		 264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1496  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4098  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.474708 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1331  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 		 362 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0314  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.265928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0590  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.155951  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0977  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.423513  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2499  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.830572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1312  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.445214  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1239  short chain dehydrogenase  32.31 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363004  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3989  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 265 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.826773  normal  0.0182099 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4563  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 		 265 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00447639  hitchhiker  0.00143466 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0180  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5596  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329102 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1110  short chain dehydrogenase  30.77 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0177225  normal  0.229286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3663  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4704  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000843868  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3574  short chain dehydrogenase  31.56 
 
 		 267 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.11528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 		 250 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0958  short chain dehydrogenase  31.92 
 
 		 265 aa  120  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3688  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 		 265 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.332248  normal  0.888803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10840  putative dehydrogenase  35.36 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000391035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4238  short chain dehydrogenase  31.66 
 
 		 268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 		 250 aa  112  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4505  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15196  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.47277 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0822  short chain dehydrogenase  34.9 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00305292  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4637  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0597104  normal  0.0798604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.845671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 253 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.42 
 
 		 260 aa  105  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.74 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0937136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2670  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 253 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.243755  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.58 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0205678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.09 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398999  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.3 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0350  short chain dehydrogenase  35.47 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1023  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.38 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2906  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.98 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.12 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3168  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 268 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.12 
 
 		 246 aa  98.6  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2157  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.89 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166791  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0878  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.787197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2742  short chain dehydrogenase  33.85 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0442377  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1422  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.16 
 
 		 244 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.92 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.7 
 
 		 262 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 		 268 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.54 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.5 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.45 
 
 		 262 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1815  short chain dehydrogenase  35.04 
 
 		 258 aa  94.7  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.644023 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0533  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.43 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3476  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.746633  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.2 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  28.46 
 
 		 268 aa  92.8  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1841  putative 3-ketoacyl-CoA reductase  34.46 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.53 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0877  short chain dehydrogenase  31.09 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1531  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.46 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50523  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.06 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4180  putative oxidoreductase  30.83 
 
 		 260 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.66264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.08 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.85 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3739  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.32 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.8 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4448  short chain dehydrogenase  31.44 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0651  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  31.54 
 
 		 251 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>