More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5751 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
254 aa  503  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0937136  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.9 
 
 
253 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.29 
 
 
253 aa  352  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1422  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.9 
 
 
253 aa  348  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2670  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.11 
 
 
253 aa  344  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.243755  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.35 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.35 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.35 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0205678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.35 
 
 
253 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.84 
 
 
253 aa  298  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398999  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  61.42 
 
 
242 aa  297  9e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.63 
 
 
253 aa  295  5e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
250 aa  284  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10840  putative dehydrogenase  57.87 
 
 
250 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000391035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.33 
 
 
250 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
256 aa  260  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.472606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5862  putative 3-ketoacyl-CoA reductase  56.75 
 
 
251 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1841  putative 3-ketoacyl-CoA reductase  44.98 
 
 
250 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.35 
 
 
253 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
253 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.851754  normal  0.710684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
256 aa  149  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.16 
 
 
256 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.02 
 
 
279 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.507862  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.68 
 
 
258 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.77 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.8 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
256 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
256 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.57 
 
 
256 aa  128  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  34.9 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.86 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1879  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
261 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.828765 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2225  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.6 
 
 
261 aa  126  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
262 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  34.94 
 
 
267 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4239  short chain dehydrogenase  34.77 
 
 
268 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0369625 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.03 
 
 
254 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3004  short chain dehydrogenase  34.67 
 
 
268 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
286 aa  122  4e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.392241  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 
255 aa  122  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.83 
 
 
257 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.29 
 
 
249 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  34.12 
 
 
258 aa  122  6e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
256 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
256 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1231  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.52 
 
 
285 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000245222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37 
 
 
262 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2554  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
244 aa  122  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  9.3114e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1215  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
244 aa  122  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.480399999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2231  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
244 aa  122  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000399569  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2034  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
244 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000773418  decreased coverage  0.000000561813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1214  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
244 aa  122  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000193485  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2508  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.4 
 
 
244 aa  122  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000339194  hitchhiker  0.00000190522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
239 aa  121  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01089  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.4 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000046254  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3959  short chain dehydrogenase  32.84 
 
 
264 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01097  hypothetical protein  34.4 
 
 
244 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000400605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  34.12 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.8 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.09 
 
 
262 aa  119  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
262 aa  120  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
256 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1472  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34 
 
 
244 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000346671  hitchhiker  0.00000000000000508287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.21 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0610  putative short-chain dehydrogenase/reductase  32.43 
 
 
286 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0678259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.062755  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.3 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1607  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.4 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000319104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  34.09 
 
 
260 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.01 
 
 
261 aa  118  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1719  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3595  tropinone reductase  33.73 
 
 
258 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.855153  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
239 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5573  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.590665  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3138  oxidoreductase protein  36.5 
 
 
262 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  32.24 
 
 
240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1857  glucose 1-dehydrogenase, putative  33.07 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.637675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.81 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1535  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0579067  normal  0.028281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1235  short chain dehydrogenase  35.83 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.183265  normal  0.0279411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
246 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0139206 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.27 
 
 
257 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
259 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
259 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>