More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5148 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_5148  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
253 aa  503  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.398999  normal  0.903635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2657  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.63 
 
 
253 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.63 
 
 
253 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0205678 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  80.63 
 
 
253 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1185  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  79.84 
 
 
242 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.22 
 
 
253 aa  331  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.47277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.43 
 
 
253 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1422  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.64 
 
 
253 aa  323  1e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182902  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2670  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.64 
 
 
253 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.243755  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5751  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  65.23 
 
 
254 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0937136  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3316  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.43 
 
 
253 aa  315  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1965  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.24 
 
 
253 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12220  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  59.68 
 
 
250 aa  298  5e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.5 
 
 
250 aa  288  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10840  putative dehydrogenase  58.5 
 
 
250 aa  284  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000391035  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5862  putative 3-ketoacyl-CoA reductase  53.78 
 
 
251 aa  255  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.19 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.472606 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
253 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.73 
 
 
253 aa  187  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1841  putative 3-ketoacyl-CoA reductase  43.95 
 
 
250 aa  183  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
253 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.851754  normal  0.710684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1734  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
247 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
259 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.92 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.507862  normal  0.704803 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
256 aa  142  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.46394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2720  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
258 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
256 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.0058487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224395  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1270  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1373  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.85 
 
 
248 aa  125  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124306  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04045  tropinone reductase  35.06 
 
 
258 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.94 
 
 
256 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36 
 
 
267 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00177695  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
256 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
256 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.166116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3597  short chain dehydrogenase  32.16 
 
 
259 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.55 
 
 
254 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
254 aa  122  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3581  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.38 
 
 
268 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.347702 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.15 
 
 
258 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
255 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0429161  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0659  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.36 
 
 
245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.372694  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
256 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0601767 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3534  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) reductase  31.73 
 
 
244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.04 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0432  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
258 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
255 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3473  short chain dehydrogenase  30.68 
 
 
259 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.639698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  31.84 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
266 aa  118  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0483  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.92 
 
 
262 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.69 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3849  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 
260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.6 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.68 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.78 
 
 
254 aa  116  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  0.250737 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3774  short chain dehydrogenase  36.51 
 
 
258 aa  117  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal  0.413475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3412  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0947163  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3485  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
269 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  34.68 
 
 
258 aa  115  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
246 aa  115  5e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0407  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1267  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3298  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  115  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2487  short chain dehydrogenase  34.51 
 
 
269 aa  115  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0517  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2582  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
261 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2339  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
256 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3449  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.93684  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3487  short chain dehydrogenase  33.6 
 
 
259 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.319531  normal  0.0832513 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4238  short chain dehydrogenase  32.3 
 
 
264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.968836 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1940  tropinone reductase  31.47 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.803191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3622  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.23 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.84 
 
 
262 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.840312  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.36 
 
 
255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.81 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.2 
 
 
247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1875  tropinone reductase  31.47 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0926  gluconate 5-dehydrogenase  31.37 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3761  short chain dehydrogenase  31.08 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0833  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.943755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2807  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
253 aa  113  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.422647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
255 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.93 
 
 
257 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.29 
 
 
255 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 
257 aa  113  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.61 
 
 
255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>