185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2558 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  50 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  36.05 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  40 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  34.97 
 
 		 173 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  37.7 
 
 		 179 aa  85.5  4e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  37.29 
 
 		 118 aa  84.7  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  37.19 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  36.09 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  37.78 
 
 		 184 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  37.6 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.67 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  34.17 
 
 		 166 aa  78.2  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  36.61 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  35.83 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  36.72 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  33.88 
 
 		 167 aa  75.9  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  31.34 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  34.17 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  33.88 
 
 		 169 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  35 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  33.88 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  35.4 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  33.86 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  31.93 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  34.19 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  31.03 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  34.17 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  31.4 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  37.39 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  35.83 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  31.67 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 172 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 198 aa  67.8  0.00000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  30.83 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  31.07 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  32.23 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  32.5 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  29.46 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  30.65 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  32.81 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  30.09 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  28.33 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  34.75 
 
 		 177 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  27.68 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  29.03 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3616  hypothetical protein  32.77 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3689  hypothetical protein  32.77 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3621  hypothetical protein  32.77 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2567  hypothetical protein  32.58 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.316058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  27.59 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12502  hypothetical protein  35.34 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.311583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  31.13 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  36.89 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  37.88 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  35.35 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  32.38 
 
 		 136 aa  51.2  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 140 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  30 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 129 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  27.13 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2262  single-strand binding protein/primosomal replication protein n  31.4 
 
 		 129 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  35 
 
 		 140 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4669  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  29 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  29 
 
 		 130 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1374  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  27.38 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  28 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2988  single-strand binding protein  29.81 
 
 		 173 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0391895 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 177 aa  48.5  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  34 
 
 		 135 aa  48.5  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>