257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1088 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  100 
 
 		 198 aa  384  1e-106  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  40.46 
 
 		 211 aa  89.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  39.69 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  44.19 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  34.62 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  36.81 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  44.71 
 
 		 174 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  32.54 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  40.22 
 
 		 170 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  40.22 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  40.22 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  40.22 
 
 		 172 aa  71.6  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  41.3 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  40.22 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  42.7 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  35.16 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  38.04 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  34.62 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  31.76 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  40.23 
 
 		 167 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  35.81 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  36.96 
 
 		 182 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  36.15 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 169 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  38.04 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  30.99 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  30.47 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  37.78 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  38.04 
 
 		 173 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  34.11 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  35.87 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  38.04 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  38.04 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  35.87 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  39.33 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  35.87 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  36.15 
 
 		 118 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  39.33 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  38.2 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  35.87 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  34.83 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  37.08 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  35.88 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  32.58 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  35.96 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  34.12 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  36.47 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  31.76 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1958  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00338031  normal  0.0286488 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  30.43 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  30.85 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  36.9 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  32.95 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  36.67 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 130 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  36.67 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 130 aa  53.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  31.76 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  32.67 
 
 		 150 aa  52.4  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  38.1 
 
 		 185 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  39.29 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0457  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 230 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  35.23 
 
 		 120 aa  51.6  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  31.63 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  31.63 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  32.22 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3622  single-strand binding protein  32.14 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0622849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  32.58 
 
 		 157 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  28.57 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  32.65 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  34.07 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  34.52 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>