More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4401 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  100 
 
 		 201 aa  402  1e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  69.82 
 
 		 179 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  68.29 
 
 		 192 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  68.85 
 
 		 193 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  69.17 
 
 		 300 aa  167  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  64.52 
 
 		 165 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  62.1 
 
 		 159 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  64.17 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  64.71 
 
 		 156 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  64.75 
 
 		 182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  61.79 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  63.93 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  64.17 
 
 		 173 aa  161  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 172 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  64.17 
 
 		 219 aa  161  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  63.03 
 
 		 168 aa  160  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  60.98 
 
 		 170 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  62.5 
 
 		 164 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  63.93 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  63.33 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  61.29 
 
 		 166 aa  158  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  64.17 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  62.3 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  62.3 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  62.5 
 
 		 188 aa  154  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  62.3 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  61.34 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  59.35 
 
 		 169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  64.35 
 
 		 178 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  60.66 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  58.82 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  58.2 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  62.6 
 
 		 170 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  63.64 
 
 		 171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  57.98 
 
 		 193 aa  138  4.999999999999999e-32  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  56.3 
 
 		 191 aa  138  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  55.46 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  59.17 
 
 		 182 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  52.89 
 
 		 170 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  52.46 
 
 		 153 aa  134  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  48.67 
 
 		 179 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  52.94 
 
 		 171 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  48.39 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  38.57 
 
 		 305 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  43.97 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  41.8 
 
 		 148 aa  95.9  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  38.32 
 
 		 118 aa  76.3  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  32.06 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  35.11 
 
 		 191 aa  73.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  32.45 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  30.67 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  34.13 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  30.17 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  38.3 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.11 
 
 		 157 aa  67  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  39.8 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  39.8 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  35.9 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.81 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  38 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  32.12 
 
 		 151 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 152 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  39.36 
 
 		 164 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 156 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  34.78 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  34 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  33.86 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  38.14 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  32 
 
 		 143 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  35.64 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.21 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  37 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  36 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  36 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  36.46 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  31.17 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  38.3 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  36 
 
 		 173 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>