More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4397 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  82.67 
 
 		 148 aa  236  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  82.55 
 
 		 146 aa  236  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  78.52 
 
 		 146 aa  222  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  77.18 
 
 		 147 aa  209  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  74.5 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  75.84 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  63.09 
 
 		 139 aa  188  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  62.42 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 143 aa  184  2e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  61.74 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  57.32 
 
 		 157 aa  184  5e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  53.69 
 
 		 161 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  66.36 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  51.98 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  51.45 
 
 		 173 aa  161  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  50.34 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  53.9 
 
 		 152 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  54.49 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  54.14 
 
 		 167 aa  157  5e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  54.49 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  69.44 
 
 		 169 aa  157  6e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  48.1 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  66.37 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 188 aa  154  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  51.66 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  52.32 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  60.55 
 
 		 200 aa  153  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  59.84 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  67.27 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  53.24 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  65.74 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  50 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 196 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 199 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 185 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 192 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 186 aa  150  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 184 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 192 aa  151  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 183 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 179 aa  150  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 184 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 184 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  56.95 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  55.64 
 
 		 236 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 177 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 		 179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 186 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  52.48 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  55.64 
 
 		 234 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  47.13 
 
 		 157 aa  149  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  55.64 
 
 		 234 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  67.62 
 
 		 155 aa  149  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  55.64 
 
 		 234 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  56.35 
 
 		 238 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  55.47 
 
 		 222 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  55.64 
 
 		 236 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  51.68 
 
 		 164 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  60.34 
 
 		 242 aa  149  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  43.09 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  50.65 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  48.04 
 
 		 171 aa  147  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 181 aa  147  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  46.2 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48.39 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 		 181 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  61.06 
 
 		 220 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  49.33 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  46.24 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  53.9 
 
 		 166 aa  144  3e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  61.95 
 
 		 231 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  53.38 
 
 		 231 aa  144  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  61.06 
 
 		 225 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 175 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  48.41 
 
 		 172 aa  144  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  60.71 
 
 		 234 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  58.2 
 
 		 178 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  46.39 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  60.36 
 
 		 177 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  60.36 
 
 		 177 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48.39 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  58.93 
 
 		 236 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  49.4 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  50 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  49.69 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  47.85 
 
 		 168 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  50 
 
 		 174 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>