More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3720 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  100 
 
 		 143 aa  293  4e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  72.41 
 
 		 143 aa  209  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 149 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  60.27 
 
 		 146 aa  169  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  62.16 
 
 		 146 aa  168  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  62.25 
 
 		 148 aa  168  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  62.33 
 
 		 146 aa  167  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  59.03 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  58.33 
 
 		 139 aa  160  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  70.09 
 
 		 147 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  56.94 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  48.08 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  49.66 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  48.61 
 
 		 161 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  61.68 
 
 		 177 aa  139  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  61.68 
 
 		 177 aa  139  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  50.34 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  44.59 
 
 		 157 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  56.67 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  60.75 
 
 		 185 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  60.75 
 
 		 185 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  48.28 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 137 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  58.26 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  59.81 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  48.97 
 
 		 164 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  61.11 
 
 		 173 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  58.88 
 
 		 167 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  48.68 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.17 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 167 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 172 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  49.02 
 
 		 165 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 169 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 188 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  61.11 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  49.67 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  57.27 
 
 		 172 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 196 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 199 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 185 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 186 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 192 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 184 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 179 aa  130  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 192 aa  130  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 184 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 183 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 182 aa  130  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 184 aa  130  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  45.1 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  47.71 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  57.41 
 
 		 184 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  58.33 
 
 		 179 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  57.41 
 
 		 187 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  57.41 
 
 		 186 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  53.72 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  63.92 
 
 		 183 aa  128  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  57.52 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  44.1 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  42.95 
 
 		 200 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  58.1 
 
 		 155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  56.19 
 
 		 171 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  53.45 
 
 		 184 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  62.89 
 
 		 189 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  54.7 
 
 		 183 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  45.16 
 
 		 159 aa  126  9.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  44.23 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  56.14 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  55.24 
 
 		 158 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  45.81 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  56.19 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  48.84 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0514  single-stranded DNA-binding protein  61.86 
 
 		 181 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0485  single-stranded DNA-binding protein  61.86 
 
 		 181 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0518  single-stranded DNA-binding protein  61.86 
 
 		 181 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.183562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  61.86 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4247  single-strand binding protein  48.46 
 
 		 246 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.301307  hitchhiker  0.0000000000394233 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 196 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 184 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 231 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  57.14 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  44.37 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  48.36 
 
 		 190 aa  123  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  52.89 
 
 		 222 aa  123  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  53.7 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  45.45 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  55.36 
 
 		 234 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  44.97 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  54.05 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  55.05 
 
 		 174 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  46.97 
 
 		 238 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  51.28 
 
 		 234 aa  120  5e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>