More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0325 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  100 
 
 
160 aa  332  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  53.59 
 
 
180 aa  183  7e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  54.34 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  56.44 
 
 
156 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  49.14 
 
 
176 aa  173  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  51.81 
 
 
166 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  55.7 
 
 
157 aa  159  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  58.68 
 
 
161 aa  152  2e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  51.88 
 
 
156 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  51.88 
 
 
156 aa  150  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  60.18 
 
 
167 aa  147  7e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  62.26 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  49.69 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  49.04 
 
 
148 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  49.04 
 
 
146 aa  144  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  56.91 
 
 
157 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  47.77 
 
 
146 aa  142  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  58.33 
 
 
186 aa  142  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  48.8 
 
 
172 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  50 
 
 
152 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  44.58 
 
 
161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  56.6 
 
 
147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  61.68 
 
 
173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  47.5 
 
 
164 aa  138  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  48.81 
 
 
174 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  50.34 
 
 
164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  44.71 
 
 
165 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  59.26 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  58.49 
 
 
167 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  47.09 
 
 
166 aa  136  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  60 
 
 
137 aa  134  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  47.47 
 
 
158 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  56.19 
 
 
149 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  48.12 
 
 
238 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  57.26 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  51.09 
 
 
175 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  47.65 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  48.89 
 
 
188 aa  133  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  59.09 
 
 
184 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  47.47 
 
 
158 aa  133  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  45.45 
 
 
171 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  44.19 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  48.51 
 
 
231 aa  131  3e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  45.95 
 
 
149 aa  131  3e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  59 
 
 
184 aa  132  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  50.85 
 
 
222 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  45.33 
 
 
234 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  45.33 
 
 
234 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  59.09 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  41.18 
 
 
200 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  45.33 
 
 
234 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  45.33 
 
 
236 aa  130  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  43.48 
 
 
143 aa  130  5e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  57.94 
 
 
183 aa  130  6e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  55.46 
 
 
167 aa  130  6.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  46.32 
 
 
236 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 
154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  50.43 
 
 
222 aa  129  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  54.96 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  47.73 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  55 
 
 
234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  50.79 
 
 
175 aa  128  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  57.01 
 
 
169 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  47.06 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  47.3 
 
 
151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  47.68 
 
 
189 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  54.63 
 
 
160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  53 
 
 
236 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  57.27 
 
 
187 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  53 
 
 
235 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  54.13 
 
 
158 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  53 
 
 
236 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  47.2 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  55.45 
 
 
214 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  53.7 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5049  single-stranded DNA-binding protein  58.65 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.274707  normal  0.047816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  45.96 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  59 
 
 
181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  53.7 
 
 
242 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  43.56 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  59 
 
 
181 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  56.36 
 
 
156 aa  125  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  55.17 
 
 
183 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  53.64 
 
 
151 aa  125  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  46.39 
 
 
165 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  55.24 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  53.7 
 
 
139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  55.24 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  55.24 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  55.24 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  55.24 
 
 
176 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  53.7 
 
 
231 aa  124  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  53.7 
 
 
225 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  53.21 
 
 
155 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  55 
 
 
180 aa  124  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  53.7 
 
 
139 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  51.85 
 
 
220 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  55.24 
 
 
185 aa  123  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  54.63 
 
 
170 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  54.7 
 
 
190 aa  123  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>