More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0455 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  100 
 
 		 174 aa  357  4e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  69.44 
 
 		 180 aa  228  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  69.49 
 
 		 176 aa  226  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  64.77 
 
 		 166 aa  206  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  60.12 
 
 		 156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  54.34 
 
 		 160 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  50.35 
 
 		 157 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  58.65 
 
 		 186 aa  138  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  57.69 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  57.69 
 
 		 156 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  56.73 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  45.96 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  54.05 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  63.54 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  56.73 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  60.19 
 
 		 160 aa  134  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 148 aa  134  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  56.73 
 
 		 164 aa  134  9e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  45.96 
 
 		 159 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  53.1 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  55.45 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  55.77 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  56.73 
 
 		 196 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  55.56 
 
 		 163 aa  132  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  56.73 
 
 		 146 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  54.81 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  50.77 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  56.48 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  58.49 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  54.31 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  45.89 
 
 		 238 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 147 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  54.81 
 
 		 184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 222 aa  127  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  48.12 
 
 		 174 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  47.34 
 
 		 162 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  46.58 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  52.29 
 
 		 157 aa  127  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  58.33 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  50.36 
 
 		 188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  41.38 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 236 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  58.33 
 
 		 137 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  46.43 
 
 		 236 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  53.51 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  41.71 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  42.53 
 
 		 154 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  55.24 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  53.7 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  58.33 
 
 		 234 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 236 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 220 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  55.66 
 
 		 219 aa  124  6e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  58 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  50.46 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 225 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  53.39 
 
 		 213 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  53.77 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  50.39 
 
 		 201 aa  123  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  43.1 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 236 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 235 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 231 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  53.64 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  54.29 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  56 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  40.54 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  54.63 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  55.05 
 
 		 143 aa  122  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  57 
 
 		 178 aa  121  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  54.29 
 
 		 185 aa  121  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  44.81 
 
 		 188 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  57.73 
 
 		 180 aa  121  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  50 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 156 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  56.19 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  41.34 
 
 		 177 aa  120  8e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.08 
 
 		 152 aa  120  8e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  56.48 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  54.29 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  55.67 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  55.67 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  62.24 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  55.67 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  55 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 		 181 aa  119  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  60 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  55.24 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>