More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2690 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  100 
 
 		 172 aa  347  7e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  83.04 
 
 		 231 aa  195  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  79.49 
 
 		 242 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  82.14 
 
 		 225 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  82.14 
 
 		 220 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  60.59 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  52.94 
 
 		 159 aa  185  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  58.24 
 
 		 158 aa  185  3e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  55.68 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  52.94 
 
 		 159 aa  184  5e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  55.62 
 
 		 165 aa  182  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  61.63 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  61.49 
 
 		 200 aa  181  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  56.57 
 
 		 171 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  76.58 
 
 		 196 aa  181  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  74.11 
 
 		 175 aa  180  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  54.3 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  70.08 
 
 		 238 aa  176  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  76.32 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  54.49 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  56.04 
 
 		 178 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  68.18 
 
 		 236 aa  174  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  68.18 
 
 		 234 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  68.18 
 
 		 234 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  68.18 
 
 		 234 aa  174  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 		 175 aa  174  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  71.93 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  68.18 
 
 		 236 aa  174  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  71.93 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  71.93 
 
 		 182 aa  174  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  71.93 
 
 		 180 aa  172  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  72.81 
 
 		 236 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  62.59 
 
 		 231 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  72.81 
 
 		 235 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  72.81 
 
 		 222 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  72.81 
 
 		 236 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  53.67 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  55.03 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  72.81 
 
 		 234 aa  171  5e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  72.17 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  72.17 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  72.17 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  72.17 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  72.17 
 
 		 176 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  57.56 
 
 		 167 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  68.1 
 
 		 188 aa  171  6.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  53.53 
 
 		 154 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  68.03 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  70.18 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  53.76 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  53.76 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  50.88 
 
 		 149 aa  167  4e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  68.7 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  69.3 
 
 		 181 aa  166  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  50.56 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  51.4 
 
 		 150 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  54.07 
 
 		 152 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  51.41 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  49.73 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  68.81 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 190 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  65.57 
 
 		 213 aa  164  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  50.86 
 
 		 182 aa  164  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  52.57 
 
 		 167 aa  163  9e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  69.72 
 
 		 230 aa  163  9e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  66.09 
 
 		 183 aa  162  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  67.86 
 
 		 233 aa  163  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  64.29 
 
 		 201 aa  161  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  65.04 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  64.91 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  64.91 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  61.61 
 
 		 222 aa  159  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  54.76 
 
 		 156 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  54.76 
 
 		 156 aa  158  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  64.96 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  52.46 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  63.96 
 
 		 181 aa  157  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  54.17 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  63.96 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 169 aa  155  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  52.91 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 182 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  53.55 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 196 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 199 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 192 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 186 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 179 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 184 aa  154  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>