More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0930 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  100 
 
 
233 aa  451  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  51.52 
 
 
177 aa  212  4.9999999999999996e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  79.09 
 
 
178 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  76.32 
 
 
178 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  75.22 
 
 
183 aa  195  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  64.97 
 
 
168 aa  194  9e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  57.8 
 
 
231 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  75.44 
 
 
181 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  76.36 
 
 
180 aa  186  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  77.27 
 
 
182 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  77.27 
 
 
182 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  77.27 
 
 
181 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  77.27 
 
 
182 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  71.9 
 
 
178 aa  186  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  71.9 
 
 
171 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  75.45 
 
 
176 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  75.45 
 
 
176 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  75.45 
 
 
176 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  75.45 
 
 
176 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  75.45 
 
 
176 aa  185  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  76.36 
 
 
176 aa  185  6e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  72.17 
 
 
165 aa  185  7e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  76.36 
 
 
180 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  66.67 
 
 
238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  74.55 
 
 
182 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  53.3 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  51.65 
 
 
219 aa  182  6e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  78.18 
 
 
234 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  65.33 
 
 
236 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  65.33 
 
 
234 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  65.33 
 
 
234 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  65.33 
 
 
234 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  65.33 
 
 
236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  72.17 
 
 
165 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  72.17 
 
 
165 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  71.65 
 
 
222 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  71.82 
 
 
176 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  65.89 
 
 
154 aa  176  2e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  74.55 
 
 
235 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  74.55 
 
 
236 aa  175  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  68.42 
 
 
167 aa  175  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  68.14 
 
 
160 aa  174  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  54.55 
 
 
174 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  67.48 
 
 
151 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  44.59 
 
 
182 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  66.67 
 
 
151 aa  173  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  71.17 
 
 
163 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  47.28 
 
 
222 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  64.1 
 
 
159 aa  171  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  68.14 
 
 
154 aa  171  6.999999999999999e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  48.74 
 
 
213 aa  171  7.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  65.22 
 
 
159 aa  171  9e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  68.1 
 
 
149 aa  170  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  64.55 
 
 
161 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  71.82 
 
 
185 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  64.55 
 
 
161 aa  169  3e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  54.91 
 
 
200 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  65.25 
 
 
164 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  43.35 
 
 
175 aa  168  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  55.19 
 
 
201 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  64.41 
 
 
168 aa  168  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  64.41 
 
 
168 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  66.67 
 
 
185 aa  167  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  67.83 
 
 
195 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  60.14 
 
 
196 aa  166  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  68.18 
 
 
155 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  48.19 
 
 
242 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  63.96 
 
 
158 aa  166  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  63.96 
 
 
158 aa  166  2.9999999999999998e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  53.75 
 
 
152 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  61.79 
 
 
188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  56.67 
 
 
160 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  51.46 
 
 
190 aa  164  8e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  61.27 
 
 
175 aa  164  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  67.86 
 
 
172 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  64.6 
 
 
175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  54.37 
 
 
175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  70.18 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  63.48 
 
 
166 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  57.33 
 
 
150 aa  162  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0611  single-stranded DNA-binding protein  67.86 
 
 
168 aa  163  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0751618  hitchhiker  0.00325806 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  64.1 
 
 
184 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  63.48 
 
 
172 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  52.9 
 
 
188 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  65.45 
 
 
175 aa  161  7e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  59.02 
 
 
159 aa  161  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  65.45 
 
 
175 aa  161  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  66.07 
 
 
167 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  66.07 
 
 
187 aa  161  9e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  68 
 
 
167 aa  160  1e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  64.29 
 
 
181 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  52.26 
 
 
162 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  70 
 
 
162 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>