More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2703 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  100 
 
 
175 aa  360  6e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  65.54 
 
 
176 aa  232  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  62.71 
 
 
175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  68.85 
 
 
192 aa  174  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  66.96 
 
 
138 aa  168  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  67.59 
 
 
166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  49.71 
 
 
151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  47.49 
 
 
152 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  54.17 
 
 
161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  44.69 
 
 
165 aa  143  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  60.71 
 
 
154 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  43.18 
 
 
157 aa  142  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  47.89 
 
 
172 aa  140  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  59.26 
 
 
186 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  42.61 
 
 
166 aa  138  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  55.26 
 
 
158 aa  136  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  56.76 
 
 
171 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  56.07 
 
 
148 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48 
 
 
159 aa  134  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  55.14 
 
 
146 aa  134  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  41.95 
 
 
157 aa  134  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  54.95 
 
 
160 aa  134  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  51.35 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  44.19 
 
 
152 aa  130  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  54.29 
 
 
149 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  50.86 
 
 
188 aa  130  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  53.57 
 
 
180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  50.79 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  42.62 
 
 
185 aa  128  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  39.78 
 
 
177 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  47.76 
 
 
146 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  51.85 
 
 
163 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  41.96 
 
 
234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  56.19 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  41.96 
 
 
234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  41.96 
 
 
234 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  40.35 
 
 
143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  49.23 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  55.24 
 
 
169 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  41.96 
 
 
236 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  41.04 
 
 
156 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  40.88 
 
 
174 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
175 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  51.38 
 
 
155 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  41.04 
 
 
156 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  46.72 
 
 
236 aa  125  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  46.67 
 
 
222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  42.11 
 
 
163 aa  124  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  51.16 
 
 
147 aa  124  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  40.71 
 
 
238 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  39.55 
 
 
171 aa  123  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  50.86 
 
 
135 aa  123  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  53.7 
 
 
137 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  52.29 
 
 
158 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  52.29 
 
 
158 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  50.86 
 
 
135 aa  122  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  51.38 
 
 
160 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  41.73 
 
 
139 aa  122  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  50.86 
 
 
135 aa  122  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  45.38 
 
 
231 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  46.73 
 
 
200 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  44.55 
 
 
222 aa  121  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  48.62 
 
 
166 aa  121  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  51 
 
 
236 aa  121  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  51 
 
 
234 aa  121  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  53.85 
 
 
167 aa  121  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  42.45 
 
 
139 aa  121  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  41.73 
 
 
139 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  47.17 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  53.4 
 
 
201 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  39.33 
 
 
181 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  39.44 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  48.76 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  51 
 
 
236 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  51 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  35.67 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  51.96 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  53.33 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  50 
 
 
146 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  38.98 
 
 
168 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  47.12 
 
 
164 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  44.86 
 
 
164 aa  119  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  52.34 
 
 
155 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  39.66 
 
 
178 aa  119  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  48.25 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  48.25 
 
 
161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  39.89 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  47.46 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  38.07 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  51.3 
 
 
167 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  51.4 
 
 
163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>