More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3665 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  100 
 
 		 180 aa  363  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  56.74 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  61.64 
 
 		 234 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  61.64 
 
 		 234 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  61.64 
 
 		 234 aa  173  9e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  61.64 
 
 		 236 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  61.64 
 
 		 236 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  60 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  54.35 
 
 		 171 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  56.74 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 166 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  58.89 
 
 		 178 aa  164  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  65.08 
 
 		 222 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  49.21 
 
 		 170 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  62.77 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  64.23 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  51.09 
 
 		 163 aa  161  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  73.47 
 
 		 234 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  62.77 
 
 		 235 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  62.77 
 
 		 236 aa  161  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  68.81 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  57.78 
 
 		 231 aa  160  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  50 
 
 		 171 aa  160  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  67.89 
 
 		 183 aa  160  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  49.45 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  49.18 
 
 		 163 aa  159  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  51.69 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  50.55 
 
 		 170 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  51.65 
 
 		 169 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  52.2 
 
 		 167 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  44.62 
 
 		 177 aa  157  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  47.75 
 
 		 165 aa  157  6e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  50 
 
 		 200 aa  157  6e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  62.61 
 
 		 184 aa  157  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  50.55 
 
 		 169 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  64.91 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  64.04 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  49.45 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  62.81 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  52.66 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  50.52 
 
 		 180 aa  155  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.7 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  52.66 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.59 
 
 		 163 aa  155  3e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  52.66 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  52.66 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  49.17 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  52.66 
 
 		 176 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  64.8 
 
 		 174 aa  154  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  63.48 
 
 		 172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  61.86 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  61.86 
 
 		 168 aa  154  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.45 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  49.73 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  62.5 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  65.22 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  70 
 
 		 156 aa  154  8e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  63.16 
 
 		 169 aa  154  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  62.73 
 
 		 233 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  48.21 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2200  single-strand binding protein  49.73 
 
 		 183 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.338329  normal  0.513026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1742  single-stranded DNA-binding protein  61.74 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.563844  normal  0.366869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  48.62 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  52.82 
 
 		 182 aa  152  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  50 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  54.49 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  48.62 
 
 		 167 aa  152  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  54.49 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2518  single-strand binding protein  63.48 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2243  single-strand binding protein  63.48 
 
 		 189 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.735655 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  54.49 
 
 		 182 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  63.87 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  66.36 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  69.61 
 
 		 154 aa  151  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  51.12 
 
 		 181 aa  151  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  63.33 
 
 		 188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  51.4 
 
 		 167 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  53.15 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2452  single-strand binding protein  61.21 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3047  single-stranded DNA-binding protein  59.65 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  49.46 
 
 		 180 aa  148  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  59.13 
 
 		 164 aa  148  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  52.2 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3737  single-strand binding protein  61.74 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0280171 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  62.28 
 
 		 176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  64.55 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  51.06 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  52.81 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  58.77 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0439  single-strand binding protein  63.16 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  60.36 
 
 		 155 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>