More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1992 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  100 
 
 		 230 aa  453  1e-127  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  62.55 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  62.18 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  73.39 
 
 		 175 aa  177  1e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  72.48 
 
 		 160 aa  175  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  70.91 
 
 		 149 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  68.07 
 
 		 154 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  69.72 
 
 		 159 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  69.72 
 
 		 159 aa  172  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  70.18 
 
 		 167 aa  171  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  68.14 
 
 		 163 aa  170  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  70.37 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  70.37 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  66.67 
 
 		 175 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  67.59 
 
 		 181 aa  167  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  65.79 
 
 		 190 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  67.59 
 
 		 162 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  55.5 
 
 		 200 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  66.38 
 
 		 178 aa  164  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  66.38 
 
 		 171 aa  164  9e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  67.59 
 
 		 184 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  69.09 
 
 		 182 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  67.59 
 
 		 155 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  69.16 
 
 		 160 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  69.37 
 
 		 172 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  67.59 
 
 		 181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  58.67 
 
 		 177 aa  162  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  63.79 
 
 		 173 aa  162  6e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  67.27 
 
 		 182 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  67.27 
 
 		 182 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  67.27 
 
 		 182 aa  162  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  68.52 
 
 		 154 aa  161  6e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  64.17 
 
 		 151 aa  161  7e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  67.59 
 
 		 187 aa  161  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  67.27 
 
 		 180 aa  161  8.000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  68.18 
 
 		 165 aa  161  8.000000000000001e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  63.33 
 
 		 151 aa  161  9e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  67.24 
 
 		 165 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  67.24 
 
 		 165 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  49.18 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 178 aa  159  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  66.36 
 
 		 185 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  65.42 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  67.59 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 176 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  66.67 
 
 		 181 aa  159  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  55.28 
 
 		 222 aa  158  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  66.09 
 
 		 185 aa  158  6e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  62.96 
 
 		 214 aa  158  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  61.61 
 
 		 188 aa  158  8e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  65.45 
 
 		 180 aa  157  9e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  59.66 
 
 		 167 aa  157  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  66.97 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  66.36 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  63.55 
 
 		 155 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  65.45 
 
 		 231 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  63.72 
 
 		 183 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  64.55 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 236 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 181 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  41.3 
 
 		 184 aa  155  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  63.48 
 
 		 167 aa  154  9e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 186 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 238 aa  153  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  54.86 
 
 		 168 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  63.72 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  60.68 
 
 		 188 aa  153  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  61.48 
 
 		 174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  63.39 
 
 		 181 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  64.55 
 
 		 236 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  62.04 
 
 		 156 aa  152  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 179 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 186 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 187 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 184 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 192 aa  152  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>