More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2140 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  67.68 
 
 		 155 aa  210  7e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  53.33 
 
 		 159 aa  176  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  52.73 
 
 		 159 aa  174  6e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  66.67 
 
 		 188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  59.38 
 
 		 154 aa  171  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  55.62 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  57.41 
 
 		 155 aa  166  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  53.05 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  67.5 
 
 		 213 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  53.14 
 
 		 188 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  71.7 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  56.76 
 
 		 190 aa  165  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  52.84 
 
 		 178 aa  165  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  47.76 
 
 		 201 aa  163  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  65.29 
 
 		 219 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  67.59 
 
 		 185 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  68.47 
 
 		 180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  50.86 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  69.16 
 
 		 230 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  63.33 
 
 		 178 aa  161  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  66.96 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  66.96 
 
 		 165 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 236 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  52.35 
 
 		 181 aa  160  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  63.56 
 
 		 167 aa  160  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 160 aa  160  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 236 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 234 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 234 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 234 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  54.49 
 
 		 162 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  51.16 
 
 		 168 aa  159  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  64.04 
 
 		 165 aa  159  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  51.52 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  52.53 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  51.52 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  48.41 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  63.33 
 
 		 222 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  68.7 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  67.92 
 
 		 181 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 182 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 182 aa  157  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  65.77 
 
 		 182 aa  157  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  49.06 
 
 		 154 aa  157  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 182 aa  157  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  59.85 
 
 		 238 aa  157  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  65.04 
 
 		 183 aa  156  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  67.83 
 
 		 189 aa  155  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  63.64 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  52.44 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  52.5 
 
 		 151 aa  155  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  61.74 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  68.63 
 
 		 178 aa  155  3e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  48.81 
 
 		 175 aa  154  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  50.63 
 
 		 152 aa  154  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  51.46 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 184 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  57.04 
 
 		 231 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  63.96 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  65.77 
 
 		 234 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  63.96 
 
 		 180 aa  154  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  61.11 
 
 		 162 aa  153  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  63.96 
 
 		 181 aa  152  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  45.62 
 
 		 222 aa  152  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  63.06 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 186 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 182 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  65.71 
 
 		 179 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  49.71 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  65.71 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  59.17 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  49.71 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  48.02 
 
 		 177 aa  150  5e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  63.06 
 
 		 236 aa  150  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  58.87 
 
 		 175 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  51.18 
 
 		 172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  61.67 
 
 		 185 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  51.72 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  51.72 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  51.72 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 184 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  51.72 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 185 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  51.72 
 
 		 176 aa  150  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 199 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 196 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  65.71 
 
 		 184 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 		 192 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  53.96 
 
 		 196 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>