More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0025 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  100 
 
 
185 aa  376  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  53.68 
 
 
177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  79.09 
 
 
163 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  52.66 
 
 
171 aa  188  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  53.72 
 
 
178 aa  188  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  75.7 
 
 
155 aa  187  5.999999999999999e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  76.36 
 
 
154 aa  187  9e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  55.74 
 
 
188 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  70.25 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  50.79 
 
 
168 aa  183  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  71.79 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  73.45 
 
 
180 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  49.47 
 
 
165 aa  182  3e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  69.91 
 
 
160 aa  182  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  52.78 
 
 
151 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  72.57 
 
 
182 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  72.57 
 
 
182 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  72.57 
 
 
182 aa  180  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  61.7 
 
 
234 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  61.7 
 
 
234 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  61.7 
 
 
234 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  61.7 
 
 
236 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  69.83 
 
 
167 aa  180  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  73.45 
 
 
165 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  73.45 
 
 
165 aa  180  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  63.97 
 
 
238 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  69.03 
 
 
175 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  61.7 
 
 
236 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48.35 
 
 
159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 
182 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  68.03 
 
 
222 aa  178  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  70.69 
 
 
181 aa  177  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  64.03 
 
 
231 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48.35 
 
 
159 aa  177  8e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  66.96 
 
 
188 aa  177  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  70.8 
 
 
180 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  52.22 
 
 
152 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  70.94 
 
 
151 aa  175  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  70.8 
 
 
176 aa  175  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  69.3 
 
 
178 aa  175  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  71.68 
 
 
234 aa  175  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  70.8 
 
 
181 aa  175  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  65.6 
 
 
175 aa  174  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  69.03 
 
 
182 aa  174  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  48.21 
 
 
184 aa  174  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  55.49 
 
 
173 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  70.91 
 
 
190 aa  173  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  68.14 
 
 
176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  64.04 
 
 
222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  68.42 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  68.42 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  68.42 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  68.42 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  68.42 
 
 
176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  69.03 
 
 
236 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  69.09 
 
 
167 aa  171  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  64.57 
 
 
130 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  69.03 
 
 
236 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  69.03 
 
 
235 aa  170  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  71.82 
 
 
233 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  72.38 
 
 
181 aa  168  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  66.36 
 
 
158 aa  168  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  66.36 
 
 
158 aa  168  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
182 aa  167  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
186 aa  167  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  62.99 
 
 
130 aa  167  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  61.67 
 
 
161 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
196 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
199 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
192 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  68.52 
 
 
162 aa  167  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  61.67 
 
 
161 aa  167  9e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
192 aa  167  9e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
169 aa  167  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
185 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
179 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  70.37 
 
 
184 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  70.48 
 
 
184 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  71.3 
 
 
178 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  68.22 
 
 
160 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 
184 aa  166  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 
186 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 
187 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  49.75 
 
 
175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  66.36 
 
 
196 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 
184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  53.33 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  69.52 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0611  single-stranded DNA-binding protein  66.39 
 
 
168 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0751618  hitchhiker  0.00325806 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  47.54 
 
 
175 aa  165  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  49.68 
 
 
200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>