More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0483 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  100 
 
 
156 aa  322  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  56.29 
 
 
167 aa  180  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  56.25 
 
 
175 aa  177  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  56.96 
 
 
151 aa  176  1e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  52.87 
 
 
171 aa  174  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  57.05 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  56.33 
 
 
157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  59.26 
 
 
162 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  51.38 
 
 
178 aa  167  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  54.44 
 
 
167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  69.37 
 
 
184 aa  161  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  68.75 
 
 
187 aa  161  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  51.19 
 
 
167 aa  158  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  47.73 
 
 
188 aa  157  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  53.85 
 
 
152 aa  157  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  65.49 
 
 
214 aa  156  9e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  63.72 
 
 
190 aa  155  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  67.86 
 
 
188 aa  155  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  44.68 
 
 
184 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  65.79 
 
 
173 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  49.71 
 
 
173 aa  152  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  67.59 
 
 
181 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 
177 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  48.19 
 
 
168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  53.74 
 
 
236 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 
175 aa  151  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  50.31 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  53.74 
 
 
236 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  66.67 
 
 
181 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  53.74 
 
 
234 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  53.74 
 
 
234 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  53.74 
 
 
234 aa  151  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  49.69 
 
 
175 aa  150  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  62.04 
 
 
230 aa  150  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  49.36 
 
 
158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
181 aa  150  8.999999999999999e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  53.47 
 
 
238 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  52.76 
 
 
163 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  59.82 
 
 
188 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  49.04 
 
 
149 aa  149  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  49.36 
 
 
158 aa  149  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  59.29 
 
 
160 aa  148  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  49.4 
 
 
165 aa  148  3e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  62.96 
 
 
154 aa  148  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 
172 aa  147  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  48.19 
 
 
167 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 
186 aa  147  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 
181 aa  147  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 
182 aa  147  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  58.27 
 
 
222 aa  147  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  63.81 
 
 
155 aa  147  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  44.94 
 
 
159 aa  147  6e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  56.91 
 
 
219 aa  147  7e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  52.86 
 
 
231 aa  146  9e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
199 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
192 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
186 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
187 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  47.68 
 
 
222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
184 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  62.16 
 
 
178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  43.64 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  55.47 
 
 
213 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  55.81 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  61.26 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  51.19 
 
 
171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  48.8 
 
 
165 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
183 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
184 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
184 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  59.82 
 
 
233 aa  144  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  55.04 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  46.54 
 
 
161 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  48.21 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  48.21 
 
 
156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  47.75 
 
 
177 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  50.28 
 
 
176 aa  143  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  60.18 
 
 
182 aa  143  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  47.75 
 
 
177 aa  143  9e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  57.26 
 
 
161 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  51.53 
 
 
157 aa  143  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  57.26 
 
 
161 aa  143  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
177 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>