More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2780 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  100 
 
 
155 aa  318  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  68.99 
 
 
160 aa  207  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  52.07 
 
 
167 aa  176  8e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  52.38 
 
 
171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  54.36 
 
 
149 aa  170  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  65.29 
 
 
219 aa  169  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  57.24 
 
 
154 aa  168  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  48.09 
 
 
190 aa  167  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 
178 aa  167  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  54.6 
 
 
181 aa  166  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  52.73 
 
 
168 aa  166  9e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  51.52 
 
 
167 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  66.1 
 
 
213 aa  166  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  52.32 
 
 
151 aa  166  1e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  53.9 
 
 
154 aa  164  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  67.59 
 
 
230 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  50.65 
 
 
152 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  54.49 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  55.06 
 
 
165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  53.42 
 
 
162 aa  161  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  54.49 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  65.74 
 
 
181 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  48.41 
 
 
159 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  65.42 
 
 
185 aa  159  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  51.66 
 
 
151 aa  159  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  50.31 
 
 
182 aa  159  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  47.77 
 
 
159 aa  158  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  47.73 
 
 
188 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  48 
 
 
177 aa  159  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  54.25 
 
 
155 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  62.5 
 
 
188 aa  158  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  59.66 
 
 
178 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  48.77 
 
 
165 aa  157  4e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  51.7 
 
 
164 aa  157  4e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 
165 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  61.34 
 
 
165 aa  157  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  52.38 
 
 
164 aa  157  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  68.63 
 
 
180 aa  156  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  47.5 
 
 
163 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  64.81 
 
 
181 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  51.57 
 
 
160 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  50.94 
 
 
161 aa  155  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 
182 aa  154  6e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  46.2 
 
 
175 aa  153  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 
182 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  66.67 
 
 
182 aa  154  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  43.48 
 
 
184 aa  152  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  58.56 
 
 
222 aa  152  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  59.65 
 
 
183 aa  153  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  65.35 
 
 
178 aa  152  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
176 aa  152  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4518  single-stranded DNA-binding protein  65.49 
 
 
183 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142427  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  59.09 
 
 
175 aa  151  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  48.88 
 
 
180 aa  150  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  50.91 
 
 
156 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  50.91 
 
 
156 aa  150  7e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  45.3 
 
 
182 aa  150  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  53.19 
 
 
238 aa  150  8e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  67 
 
 
234 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  54.93 
 
 
236 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  54.93 
 
 
234 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  49.14 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  49.14 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  49.14 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  49.14 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  55.91 
 
 
222 aa  149  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  61.06 
 
 
201 aa  149  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  49.14 
 
 
176 aa  149  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  54.93 
 
 
234 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  56.25 
 
 
231 aa  149  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  54.93 
 
 
234 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  55.47 
 
 
236 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  49.06 
 
 
161 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0656  single-stranded DNA-binding protein  64.6 
 
 
189 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  53.08 
 
 
130 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
186 aa  148  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  47.19 
 
 
181 aa  149  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
182 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  61.16 
 
 
183 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  57.55 
 
 
196 aa  148  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  52.31 
 
 
130 aa  147  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  48.28 
 
 
176 aa  147  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
196 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  59.29 
 
 
175 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  49.37 
 
 
162 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
192 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
186 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
179 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
187 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
184 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
192 aa  147  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  60.19 
 
 
183 aa  147  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 
184 aa  147  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>