More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1280 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  100 
 
 		 164 aa  335  9.999999999999999e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  97.56 
 
 		 164 aa  313  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  95.73 
 
 		 164 aa  311  2.9999999999999996e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  62.42 
 
 		 161 aa  210  7.999999999999999e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  66.67 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  66.67 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  55.41 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  56.02 
 
 		 181 aa  174  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  57.86 
 
 		 238 aa  170  7.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  53.89 
 
 		 168 aa  170  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  55.19 
 
 		 151 aa  169  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  56.64 
 
 		 236 aa  167  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  56.64 
 
 		 234 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  56.64 
 
 		 234 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  56.64 
 
 		 234 aa  167  6e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  50 
 
 		 152 aa  167  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  55.94 
 
 		 236 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  61.98 
 
 		 222 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  54.29 
 
 		 231 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  53.9 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  68.32 
 
 		 236 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  53.25 
 
 		 154 aa  161  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  63.81 
 
 		 200 aa  160  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  68.32 
 
 		 235 aa  160  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  68.32 
 
 		 234 aa  160  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  51.7 
 
 		 188 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  68.32 
 
 		 236 aa  160  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  54.49 
 
 		 171 aa  160  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  49.69 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  51.01 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  63.55 
 
 		 167 aa  158  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  58.73 
 
 		 190 aa  158  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  50.29 
 
 		 177 aa  158  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  51.68 
 
 		 146 aa  158  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  48.89 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  61.9 
 
 		 196 aa  157  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  49.68 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  50.33 
 
 		 148 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  54.05 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  52.67 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  64.96 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  50.97 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  64.96 
 
 		 165 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  66.97 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  53.85 
 
 		 160 aa  153  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  61.48 
 
 		 178 aa  153  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  46.15 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  55.04 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  50.6 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 176 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 184 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  48.24 
 
 		 182 aa  151  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  59.82 
 
 		 242 aa  151  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3876  single-strand binding protein  50.3 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.611448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  44.23 
 
 		 159 aa  150  7e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  67.33 
 
 		 182 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  50.66 
 
 		 155 aa  150  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  61.47 
 
 		 225 aa  150  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  61.95 
 
 		 183 aa  150  8.999999999999999e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  50.68 
 
 		 146 aa  149  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  52.7 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  60.55 
 
 		 231 aa  149  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 186 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 187 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  47.56 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  66.36 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  61.39 
 
 		 233 aa  149  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 186 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  60.71 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  62.96 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  48.5 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 179 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 199 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  61.11 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.47 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 196 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  52.7 
 
 		 130 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 192 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  59.63 
 
 		 220 aa  148  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  63.89 
 
 		 192 aa  148  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 146 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  64.22 
 
 		 181 aa  148  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  57.76 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  57.76 
 
 		 161 aa  147  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  63.3 
 
 		 176 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>