242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7360 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  100 
 
 
233 aa  475  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  49.32 
 
 
190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  38.78 
 
 
191 aa  109  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  44.92 
 
 
118 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  40 
 
 
179 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  40.87 
 
 
189 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  37.9 
 
 
166 aa  94.7  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  40.34 
 
 
170 aa  91.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2420  single-strand binding protein  36.61 
 
 
192 aa  91.7  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0230059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19560  single stranded DNA-binding protein  34.81 
 
 
173 aa  91.7  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0239193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  41.44 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  38.02 
 
 
153 aa  90.5  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  38.52 
 
 
165 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  37.5 
 
 
159 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  32.28 
 
 
167 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  39.5 
 
 
171 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  38.79 
 
 
156 aa  89.4  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  37.82 
 
 
170 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  37.93 
 
 
173 aa  89  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  41.18 
 
 
230 aa  88.6  8e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  34.38 
 
 
183 aa  88.2  9e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  37.07 
 
 
192 aa  87.8  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  37.07 
 
 
193 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 
164 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 
172 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 
172 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  37.93 
 
 
172 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  37.93 
 
 
195 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  40.54 
 
 
305 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  37.82 
 
 
177 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  35.29 
 
 
182 aa  84.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  35.29 
 
 
169 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  36.97 
 
 
198 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  36.21 
 
 
300 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  33.61 
 
 
188 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  36.13 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  36.13 
 
 
165 aa  82.8  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  35.34 
 
 
163 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  36.13 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 
191 aa  82  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  36.97 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  35.34 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  36.21 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  32.77 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  36.07 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  34.45 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  37.82 
 
 
170 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  39.66 
 
 
182 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1811  single-strand binding protein  37.86 
 
 
188 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0567854  normal  0.0158979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  32.56 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  39.09 
 
 
240 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1076  single-strand binding family protein  37.5 
 
 
161 aa  79  0.00000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7361  single-strand binding protein  35.34 
 
 
184 aa  78.6  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.901267  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  33.62 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1088  single-strand binding protein  34.62 
 
 
198 aa  78.2  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.651854  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  33.61 
 
 
189 aa  77.8  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  34.29 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2173  single-strand binding protein  33.59 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000827333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1368  single-strand binding protein  38.02 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0510116  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  30 
 
 
218 aa  72  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  32.06 
 
 
179 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  33.94 
 
 
151 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08890  single stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 
178 aa  68.9  0.00000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.193976  normal  0.0417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  34.11 
 
 
148 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0930  single-strand binding protein  34.4 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  30 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1351  single-strand binding protein  36.61 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0852946  hitchhiker  0.0000589193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2643  single-strand binding protein  32.82 
 
 
173 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  28.45 
 
 
179 aa  63.2  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  31.9 
 
 
148 aa  62.8  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  34.65 
 
 
181 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  33.66 
 
 
181 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  29 
 
 
190 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  34.31 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  28.28 
 
 
130 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  32.67 
 
 
187 aa  58.9  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  26.05 
 
 
174 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  27.27 
 
 
130 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  31 
 
 
181 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1907  single-stranded DNA-binding protein  47.06 
 
 
191 aa  58.5  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 
185 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  31.25 
 
 
201 aa  58.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 
185 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  28.28 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  32.54 
 
 
188 aa  57.4  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  29 
 
 
181 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  29 
 
 
188 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  31 
 
 
151 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  31 
 
 
151 aa  56.2  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  26.26 
 
 
177 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  26.26 
 
 
177 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  28 
 
 
167 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  31 
 
 
184 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  29.6 
 
 
152 aa  55.1  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  29 
 
 
186 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  29.7 
 
 
162 aa  55.1  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  29 
 
 
182 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  29 
 
 
186 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>