More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4232 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4232  single-strand binding protein  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000994037  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4401  single-strand binding protein  69.82 
 
 		 201 aa  225  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000415912  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4119  single-strand binding protein  73.98 
 
 		 192 aa  185  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3890  single-strand binding protein  75.41 
 
 		 193 aa  185  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0415536 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4638  single-strand binding protein  71.77 
 
 		 300 aa  179  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4180  single-strand binding protein  72.95 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4739  single-strand binding protein  72.88 
 
 		 173 aa  177  5.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0875  single-stranded DNA-binding protein  69.92 
 
 		 170 aa  177  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37800  single-strand binding protein  69.67 
 
 		 166 aa  174  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5067  single-strand binding protein  68.85 
 
 		 159 aa  174  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5368  single-strand binding protein  56.36 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39400  single-strand binding protein  71.19 
 
 		 156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0336  single-strand binding protein  68.03 
 
 		 219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.676311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2524  single-strand binding protein  68.03 
 
 		 188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4338  single-strand binding protein  64.75 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5745  single-stranded DNA-binding protein  69.49 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.26474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5369  single-stranded DNA-binding protein  69.49 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5458  single-stranded DNA-binding protein  69.49 
 
 		 172 aa  171  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.268311  normal  0.0145668 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  65.04 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3699  single-strand binding protein  68.03 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10053  single-stranded DNA-binding protein  67.8 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000020035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  71.3 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2821  single-strand binding protein  68.03 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000844466  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7040  single-strand binding protein  65.57 
 
 		 168 aa  167  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4663  single-strand binding protein  63.93 
 
 		 188 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  64.75 
 
 		 189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6033  single-stranded DNA-binding protein  69.11 
 
 		 170 aa  161  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.68434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4521  single-stranded DNA-binding protein  64.75 
 
 		 186 aa  160  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23250  single stranded DNA-binding protein  62.3 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5067  single-strand binding protein  64.23 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4555  single-strand binding protein  64.23 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184905  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7311  single-stranded DNA-binding protein  64.75 
 
 		 193 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0328118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5049  single-strand binding protein  69.09 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31770  single-strand binding protein  66.09 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9356  single-stranded DNA-binding protein  61.16 
 
 		 191 aa  154  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4843  single-strand binding protein  59.02 
 
 		 195 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  59.02 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3560  single-strand binding protein  57.72 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.861693 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4948  single-strand binding protein  58.68 
 
 		 170 aa  151  5e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0128  single-strand binding protein  60.17 
 
 		 163 aa  150  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0299723 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  56.41 
 
 		 218 aa  143  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3094  single-stranded DNA-binding protein  60.66 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0250576  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0309  single-strand binding family protein  57.63 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0940185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1177  single-stranded DNA-binding protein  57.26 
 
 		 179 aa  141  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0928  single-strand binding protein  50.78 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9002  single-strand binding protein  52.42 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.850142  normal  0.715469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5321  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 305 aa  111  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1620  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 179 aa  111  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.777207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1145  single-stranded DNA-binding protein  44.64 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  45.08 
 
 		 148 aa  104  7e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3020  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 174 aa  84.7  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.666273  normal  0.0842744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3556  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3930  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.241306  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4668  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  41.12 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0382232  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.38 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7360  Single-stranded DNA-binding protein-like protein  32.06 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1327  single-strand binding protein  31.91 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2025  single-strand binding protein/Primosomal replication protein n  29.77 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  31.41 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  40.82 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  38 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  38 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24720  single stranded DNA-binding protein  36.43 
 
 		 211 aa  67.8  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0081931  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09740  single stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  30.46 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  38.61 
 
 		 114 aa  65.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  34.33 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1521  single-strand binding protein  37.23 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.232258  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  38 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1126  single-strand binding protein  35.4 
 
 		 174 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  37 
 
 		 172 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  39.6 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  37 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  37.25 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  35.92 
 
 		 157 aa  64.3  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  34.95 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 156 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  36.27 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2558  single-strand binding protein  29.63 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.752776 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  37 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>