More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2929 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  100 
 
 
156 aa  314  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  73.42 
 
 
156 aa  218  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  55.49 
 
 
164 aa  169  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  54.22 
 
 
164 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  52.94 
 
 
170 aa  167  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  52.02 
 
 
173 aa  165  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  53.66 
 
 
164 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  52.66 
 
 
169 aa  164  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  51.45 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  51.45 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  51.45 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  51.45 
 
 
173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  51.74 
 
 
172 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  51.16 
 
 
172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  51.16 
 
 
172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  52.23 
 
 
156 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  52.23 
 
 
156 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  52.23 
 
 
156 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  52.23 
 
 
156 aa  154  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  63.11 
 
 
137 aa  149  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  55.06 
 
 
154 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  55.77 
 
 
139 aa  147  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  52.23 
 
 
150 aa  141  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  42.44 
 
 
172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  50 
 
 
140 aa  137  4.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 
169 aa  137  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  42.77 
 
 
172 aa  137  6e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  50 
 
 
136 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  50.64 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  50.64 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  63.3 
 
 
140 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  47.34 
 
 
167 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  47.34 
 
 
167 aa  135  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  46.43 
 
 
166 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  47.44 
 
 
148 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  43.1 
 
 
163 aa  131  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  41.18 
 
 
187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  48.73 
 
 
142 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  41.67 
 
 
138 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  45.86 
 
 
148 aa  127  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  46.79 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  41.49 
 
 
188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  57.02 
 
 
133 aa  124  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  45.64 
 
 
185 aa  122  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  43.59 
 
 
138 aa  121  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  55.66 
 
 
119 aa  120  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  54.37 
 
 
114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
111 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  50.48 
 
 
112 aa  114  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  46.21 
 
 
142 aa  114  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  49.52 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  49.52 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  49.52 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 
111 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  50.48 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  49.55 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  54.9 
 
 
138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.24 
 
 
157 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  47.62 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  44.64 
 
 
121 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  38.51 
 
 
160 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  39.24 
 
 
172 aa  105  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  44.64 
 
 
141 aa  104  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  50 
 
 
166 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  38.61 
 
 
157 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  42.86 
 
 
166 aa  102  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  36.77 
 
 
136 aa  102  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  42.36 
 
 
143 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.31 
 
 
134 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  49.04 
 
 
146 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  44.95 
 
 
141 aa  100  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  41.82 
 
 
114 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  35.26 
 
 
129 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  41.82 
 
 
114 aa  100  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  48.11 
 
 
161 aa  100  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  48.08 
 
 
147 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  45.19 
 
 
149 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 
131 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  44.54 
 
 
150 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  44.54 
 
 
150 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  44.23 
 
 
186 aa  98.6  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  38.56 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  37.65 
 
 
165 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  43.8 
 
 
174 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  37.59 
 
 
142 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  42.31 
 
 
148 aa  97.1  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  37.65 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  42.31 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  39.1 
 
 
130 aa  96.3  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  37.58 
 
 
171 aa  95.9  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  40.3 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  41.53 
 
 
135 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  37.18 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  36.71 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  38.1 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  39.16 
 
 
146 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  40.68 
 
 
135 aa  94  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>