More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2502 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 166 aa  342  2e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  69.95 
 
 		 172 aa  245  2e-64  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  70.62 
 
 		 163 aa  241  5e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  65.06 
 
 		 138 aa  211  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  62.65 
 
 		 141 aa  204  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  62.05 
 
 		 138 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  56.57 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  59.54 
 
 		 164 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  57.22 
 
 		 173 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  57.22 
 
 		 173 aa  187  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  57.22 
 
 		 173 aa  187  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  57.22 
 
 		 173 aa  187  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  59.17 
 
 		 164 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  56.67 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  56.32 
 
 		 169 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  56.98 
 
 		 172 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  56.98 
 
 		 172 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  56.8 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  56.42 
 
 		 172 aa  184  6e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  54.02 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  51.81 
 
 		 188 aa  173  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  49.74 
 
 		 187 aa  169  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  60.28 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  48.81 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  48.81 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  48.81 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  48.81 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  51.18 
 
 		 169 aa  159  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 167 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  49.4 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  49.4 
 
 		 142 aa  147  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  62.86 
 
 		 119 aa  145  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  59.2 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  56.76 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 		 112 aa  141  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  59.81 
 
 		 114 aa  140  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  56.76 
 
 		 111 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  56.76 
 
 		 111 aa  140  7e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 		 111 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  47.02 
 
 		 156 aa  140  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  43.98 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  55.86 
 
 		 111 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  54.95 
 
 		 112 aa  135  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 		 121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  43.11 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  44.31 
 
 		 148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  40.72 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  52.29 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  41.32 
 
 		 150 aa  117  7e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  49.54 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 129 aa  111  5e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  40.36 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  44.04 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  49.09 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  37.95 
 
 		 142 aa  108  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  36.31 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  37.72 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  48.6 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  36.97 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  34.13 
 
 		 139 aa  104  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  41.6 
 
 		 138 aa  104  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  41.22 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  44.19 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  44.19 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  42.72 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  42.72 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  37.95 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  36.53 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  35.33 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  39.23 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 133 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  36.09 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  37.86 
 
 		 143 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  36.69 
 
 		 157 aa  98.2  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 146 aa  97.8  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 147 aa  97.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 167 aa  97.4  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  37.43 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.92 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  42.19 
 
 		 176 aa  95.5  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  45.1 
 
 		 134 aa  94.7  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  36.23 
 
 		 149 aa  94.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  38.05 
 
 		 134 aa  94  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  33.15 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  34.08 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 180 aa  92  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.71 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  32.64 
 
 		 161 aa  92  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  34.91 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  34.46 
 
 		 166 aa  91.3  6e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  34.5 
 
 		 157 aa  90.9  7e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>