More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2873 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  100 
 
 
125 aa  260  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  100 
 
 
125 aa  260  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  72.06 
 
 
136 aa  191  3e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  59.18 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  44.83 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  44.83 
 
 
150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  44.27 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  41.88 
 
 
164 aa  104  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
169 aa  103  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
173 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
173 aa  103  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
172 aa  103  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
173 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
172 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
173 aa  103  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 
170 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  44.9 
 
 
150 aa  103  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  44.86 
 
 
164 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  40.17 
 
 
173 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  40.17 
 
 
172 aa  102  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  40.62 
 
 
188 aa  101  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  45.63 
 
 
187 aa  100  9e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  47.47 
 
 
224 aa  99.8  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  38.57 
 
 
141 aa  98.2  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 
166 aa  98.2  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  41.8 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  40.54 
 
 
112 aa  97.4  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  45.37 
 
 
156 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  45.37 
 
 
156 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  45.37 
 
 
156 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  45.37 
 
 
156 aa  97.1  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  38.74 
 
 
112 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  42.72 
 
 
164 aa  95.5  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  37.5 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  38.21 
 
 
172 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  45.28 
 
 
154 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 
163 aa  94.4  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
111 aa  93.6  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  36.72 
 
 
130 aa  93.6  9e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  37.14 
 
 
156 aa  93.2  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  45.79 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  44.12 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  42.72 
 
 
156 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  40.71 
 
 
114 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  40.71 
 
 
114 aa  92  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  37.8 
 
 
185 aa  92  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  44.12 
 
 
114 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  43.48 
 
 
134 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  41.51 
 
 
119 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 
172 aa  91.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  40.57 
 
 
121 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 
131 aa  91.3  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  38.89 
 
 
142 aa  90.9  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  40.54 
 
 
133 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  45.28 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  39.64 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  37.86 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
111 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 
111 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  42.15 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  40.18 
 
 
142 aa  87.8  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  36.36 
 
 
168 aa  87.8  5e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  40.16 
 
 
136 aa  87  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  40.78 
 
 
167 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  40.78 
 
 
167 aa  87  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  35.14 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  41.28 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 
169 aa  85.5  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0025  single-strand DNA-binding protein  39.66 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  38.84 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  38.89 
 
 
161 aa  84.3  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  35.29 
 
 
176 aa  84.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  40.78 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  40.78 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  37.68 
 
 
138 aa  83.6  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  31.3 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  34.68 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  39.05 
 
 
140 aa  83.2  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  37.25 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  35.58 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  36.54 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  34.59 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  32.82 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  33.06 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  34.07 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  36.19 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  30 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  34.29 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  30.3 
 
 
135 aa  77.4  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  38.02 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  34.62 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3354  single-strand binding protein  39.22 
 
 
189 aa  77  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26580  single-strand binding protein  38 
 
 
189 aa  77  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.195402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2132  single-strand binding protein  41.41 
 
 
153 aa  77  0.00000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  36.04 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>