More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0425 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  100 
 
 
167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  100 
 
 
167 aa  338  2.9999999999999998e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  81.66 
 
 
169 aa  247  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  67.66 
 
 
164 aa  218  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  64.37 
 
 
170 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  63.84 
 
 
173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  63.84 
 
 
173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  63.84 
 
 
173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  63.84 
 
 
173 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  63.28 
 
 
173 aa  213  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  66.47 
 
 
156 aa  213  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  66.47 
 
 
156 aa  213  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  66.47 
 
 
156 aa  213  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  66.47 
 
 
156 aa  213  9e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  67.26 
 
 
164 aa  212  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  64.16 
 
 
169 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  63.64 
 
 
172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  63.64 
 
 
172 aa  212  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  63.07 
 
 
172 aa  210  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  65.09 
 
 
164 aa  207  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  61.68 
 
 
142 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  61.68 
 
 
142 aa  187  5e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  52.87 
 
 
172 aa  175  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  52.63 
 
 
163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 
172 aa  170  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  52.38 
 
 
166 aa  167  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  52.1 
 
 
138 aa  167  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  48.94 
 
 
188 aa  159  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  48.44 
 
 
187 aa  157  7e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  49.1 
 
 
138 aa  155  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  63.39 
 
 
137 aa  149  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  49.1 
 
 
156 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  46.11 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  44.05 
 
 
154 aa  136  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  55.66 
 
 
112 aa  135  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  55.66 
 
 
111 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
112 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
112 aa  134  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
112 aa  134  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  54.24 
 
 
185 aa  133  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  57.69 
 
 
119 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 
111 aa  130  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  56.6 
 
 
114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  53.57 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 
111 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 
112 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  53.77 
 
 
111 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  58.65 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  43.2 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  57.28 
 
 
150 aa  123  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  40.72 
 
 
148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  40.12 
 
 
150 aa  118  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  40.4 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  49.17 
 
 
133 aa  110  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  39.29 
 
 
139 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  50 
 
 
140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  44.7 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  52.29 
 
 
140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  49.53 
 
 
146 aa  107  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  47.17 
 
 
131 aa  104  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  37.43 
 
 
142 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  47.62 
 
 
161 aa  102  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  41.44 
 
 
129 aa  101  4e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 
130 aa  101  5e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  42.75 
 
 
150 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  42.75 
 
 
150 aa  100  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  40.31 
 
 
146 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  36.63 
 
 
157 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  36.31 
 
 
157 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  38.1 
 
 
166 aa  99  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  42.2 
 
 
146 aa  98.2  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36 
 
 
172 aa  98.2  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  37.21 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  40.16 
 
 
138 aa  97.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  42.59 
 
 
174 aa  97.4  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  44.23 
 
 
146 aa  96.7  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  41.67 
 
 
141 aa  96.7  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  45.19 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  43.93 
 
 
166 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  35.51 
 
 
160 aa  95.1  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  36.26 
 
 
165 aa  93.2  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  41.35 
 
 
149 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  45.26 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  45.26 
 
 
114 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  32.74 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  32.74 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  40 
 
 
176 aa  92.8  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  38.14 
 
 
139 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  31.55 
 
 
151 aa  92  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  42.45 
 
 
134 aa  92  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.38 
 
 
157 aa  91.7  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.12 
 
 
156 aa  91.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  42.73 
 
 
168 aa  90.9  7e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.93 
 
 
148 aa  90.9  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  40.35 
 
 
143 aa  90.5  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  39.62 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  37.29 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  40.18 
 
 
143 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  36.44 
 
 
139 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>