More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4935 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  60 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  59.23 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  59.23 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  59.23 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  59.23 
 
 		 173 aa  164  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  59.23 
 
 		 170 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  59.69 
 
 		 172 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  58.91 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  58.91 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  58.91 
 
 		 169 aa  161  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  58.46 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  55.84 
 
 		 154 aa  159  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  58.21 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  57.46 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  54.84 
 
 		 150 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  65.25 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  63.39 
 
 		 169 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  63.11 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  53.28 
 
 		 150 aa  149  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  52.14 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  57.55 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 167 aa  147  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  52.82 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  52.82 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  55.03 
 
 		 148 aa  145  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  54.68 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  47.24 
 
 		 163 aa  141  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  52.14 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  57.66 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  57.66 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  57.66 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  48.65 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  46.51 
 
 		 172 aa  140  4e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  57.66 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  46.11 
 
 		 166 aa  140  6e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  53.9 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  63.11 
 
 		 119 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  56.43 
 
 		 140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  51.75 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  55.96 
 
 		 187 aa  134  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  47.79 
 
 		 185 aa  133  9e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  48.99 
 
 		 188 aa  133  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  57.55 
 
 		 114 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  45.77 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  59.09 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  58.49 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  51.89 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  51.35 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  46.9 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 112 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  49.55 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  49.55 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  49.55 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  49.55 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 111 aa  115  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  48.6 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  44.37 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  47.29 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  47.29 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 111 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  48.65 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  47.75 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  40.15 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  46.43 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  38.06 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  50 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  40.79 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  43.15 
 
 		 149 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  46.53 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  46.53 
 
 		 114 aa  105  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  41.98 
 
 		 165 aa  104  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  41.84 
 
 		 136 aa  103  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  43.62 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  41.13 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  35.9 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  43.88 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  40.43 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  37.58 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  40.43 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  45.28 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  37.41 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  38.13 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  40.56 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  40 
 
 		 148 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  43.66 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  42.98 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  39.37 
 
 		 180 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  39.01 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  50 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  33.81 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  38.41 
 
 		 135 aa  96.7  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>