More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0484 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  53.41 
 
 		 154 aa  192  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  39.34 
 
 		 173 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  39.34 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  37.78 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  37.78 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  40.82 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  45.24 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  46.22 
 
 		 150 aa  107  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  37.29 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  45 
 
 		 134 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  43.61 
 
 		 142 aa  98.6  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 166 aa  98.2  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.16 
 
 		 172 aa  98.2  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 157 aa  97.8  7e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  35.8 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  38.42 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 154 aa  94.4  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  35.56 
 
 		 136 aa  94.4  8e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.56 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  37.98 
 
 		 138 aa  93.6  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  43.64 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  33.7 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  35.48 
 
 		 187 aa  91.7  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 157 aa  90.9  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 142 aa  90.9  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 142 aa  90.9  9e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  39.47 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  44.64 
 
 		 119 aa  90.1  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  41.82 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  41.82 
 
 		 167 aa  88.6  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  37.98 
 
 		 146 aa  88.2  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  46.36 
 
 		 138 aa  88.2  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2263  single-strand binding protein  39.17 
 
 		 119 aa  87.8  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000000257141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  41.74 
 
 		 114 aa  87.4  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  42.24 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 156 aa  87.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  37.8 
 
 		 172 aa  87.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  38.93 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  38.28 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  41.23 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 146 aa  86.3  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  41.82 
 
 		 142 aa  85.5  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  40 
 
 		 160 aa  85.5  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  35.8 
 
 		 150 aa  85.5  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  43.86 
 
 		 140 aa  85.5  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  39.83 
 
 		 157 aa  85.5  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  42.4 
 
 		 137 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  43.7 
 
 		 148 aa  84.3  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  42.98 
 
 		 138 aa  84.3  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 125 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 146 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 141 aa  84  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 125 aa  84  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  38.66 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  44.14 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  37.39 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  32.12 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  32.12 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  45.05 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.12 
 
 		 166 aa  81.6  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 140 aa  81.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  32.53 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 161 aa  81.3  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  38.26 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  29.69 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  31.93 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  38.14 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  40 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>