More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1595 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  100 
 
 		 129 aa  259  6e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  53.9 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  53.9 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  42.55 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  48.6 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 172 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 169 aa  114  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 170 aa  114  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  44.27 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  44.27 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  38.41 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  41.55 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  39.86 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  37.41 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 142 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 187 aa  105  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 		 169 aa  104  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  43.36 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  43.36 
 
 		 114 aa  103  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  47.57 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  35.26 
 
 		 156 aa  100  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 111 aa  100  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 111 aa  99.4  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  37.76 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  46.67 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  37.76 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 167 aa  99.8  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 111 aa  99  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  44.04 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 185 aa  97.4  5e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 111 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  39.84 
 
 		 172 aa  97.1  8e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  38.81 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1985  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.73019e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 		 188 aa  95.5  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  44.66 
 
 		 114 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  43.64 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  42.72 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  37.4 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1615  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000019997  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  36.92 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 148 aa  90.5  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  36.17 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 142 aa  89.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 166 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  36.57 
 
 		 133 aa  88.2  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0811  single-strand binding protein  36.77 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000022437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  35.25 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  35.04 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  36.57 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  38.21 
 
 		 133 aa  84.7  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0438  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000830836  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  36.69 
 
 		 139 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  36.69 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  44.9 
 
 		 176 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 192 aa  83.6  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  36.69 
 
 		 139 aa  83.6  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  36.67 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  40 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.59 
 
 		 172 aa  80.5  0.000000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  39.84 
 
 		 136 aa  80.1  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  29.73 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>