More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2617 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  100 
 
 		 224 aa  431  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  44.54 
 
 		 136 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 125 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 125 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  50 
 
 		 140 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  48.21 
 
 		 148 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  45.3 
 
 		 136 aa  98.6  7e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 134 aa  97.1  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 134 aa  94.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  48 
 
 		 150 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  48 
 
 		 150 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 141 aa  92.8  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  37.84 
 
 		 125 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 137 aa  91.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 168 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  42.15 
 
 		 172 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  36.7 
 
 		 125 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  36.23 
 
 		 147 aa  91.3  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  42.15 
 
 		 173 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 135 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 135 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  44 
 
 		 150 aa  90.5  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 135 aa  90.5  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  45.54 
 
 		 149 aa  90.5  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 169 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 172 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 172 aa  89.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 137 aa  89.7  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 170 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 173 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 166 aa  89.4  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  41.32 
 
 		 164 aa  89.4  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 163 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  41.07 
 
 		 164 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 161 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  48.08 
 
 		 148 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 164 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 122 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  32.26 
 
 		 127 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 159 aa  87.8  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 122 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 133 aa  87  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 176 aa  87.4  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 128 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0008  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 187 aa  86.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000109058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 156 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 154 aa  85.9  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 174 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 123 aa  85.5  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  39.2 
 
 		 129 aa  85.5  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  43.86 
 
 		 176 aa  85.1  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 129 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  34.91 
 
 		 129 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  37.61 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 119 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 114 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3142  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467744  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  41.38 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2003  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000170314  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  36.36 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  38.52 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  44.14 
 
 		 206 aa  81.6  0.000000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.59 
 
 		 161 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4168  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2193  single-stranded DNA-binding protein  36.61 
 
 		 112 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.166316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.45 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  35.65 
 
 		 172 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  37.74 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2013  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00346056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1967  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000581138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2168  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 112 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000365477  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2311  single-stranded DNA-binding protein  37.04 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000965413  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  43 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 165 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  37.27 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  37.14 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  39.45 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2176  single-stranded DNA-binding protein  36.11 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00013213  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2228  single-stranded DNA-binding protein  35.19 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000027082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  31.51 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>