More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_01781 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  84.38 
 
 		 125 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  85.16 
 
 		 125 aa  218  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  82.17 
 
 		 129 aa  205  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  82.17 
 
 		 129 aa  205  1e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  70.9 
 
 		 127 aa  192  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  77.36 
 
 		 123 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  76.42 
 
 		 124 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  75.47 
 
 		 133 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  71.3 
 
 		 123 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  70.64 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  68.47 
 
 		 119 aa  161  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  70.64 
 
 		 122 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  68.52 
 
 		 120 aa  158  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  61.9 
 
 		 123 aa  158  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  65.45 
 
 		 120 aa  154  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  61.02 
 
 		 120 aa  150  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  49.52 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  39.82 
 
 		 115 aa  97.1  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  38.71 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.8 
 
 		 206 aa  89.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 163 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 224 aa  87.4  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  38.71 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  41.51 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  39.5 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 188 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 220 aa  84.7  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  40.91 
 
 		 175 aa  84.3  5e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 231 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 171 aa  83.6  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  37.72 
 
 		 164 aa  83.6  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  35 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  35.19 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.38 
 
 		 188 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  32.58 
 
 		 160 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  34.75 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 171 aa  79.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 187 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  34.68 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 170 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  32.59 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  40.78 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.05 
 
 		 166 aa  77.4  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  33.86 
 
 		 209 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 164 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  34.75 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  40.82 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  37.17 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  34.13 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  31.85 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  36.92 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  34.82 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  41.86 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  32.84 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  30.82 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  31.62 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  31.47 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  32.54 
 
 		 176 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  32.84 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>