More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1690 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  100 
 
 		 137 aa  275  1e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  51.47 
 
 		 152 aa  141  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 161 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 163 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 161 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  40.58 
 
 		 130 aa  103  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  39.55 
 
 		 206 aa  103  7e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  45.95 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  49.04 
 
 		 168 aa  100  7e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  44.34 
 
 		 209 aa  100  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  37.41 
 
 		 137 aa  100  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  45.28 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  36.73 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  36.76 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 149 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  38.4 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 183 aa  97.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 182 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.54 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 166 aa  97.4  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  46.23 
 
 		 182 aa  97.4  6e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  44.23 
 
 		 146 aa  97.1  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  36.76 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  37.12 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  37.06 
 
 		 146 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  41.96 
 
 		 161 aa  96.7  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  39.01 
 
 		 143 aa  95.9  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 185 aa  95.5  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 146 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  38.13 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  45.28 
 
 		 188 aa  94.7  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  33.1 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 152 aa  94.4  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  35.21 
 
 		 164 aa  94.4  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  34.9 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 141 aa  94  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0633  single-stranded DNA-binding protein  32.41 
 
 		 172 aa  94  7e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000194148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 146 aa  93.6  8e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  44.34 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  35.46 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  38.73 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  40 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 222 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  43.4 
 
 		 190 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  37.06 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  45.92 
 
 		 177 aa  91.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  41.9 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 238 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 171 aa  91.3  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  45 
 
 		 182 aa  91.3  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 183 aa  91.3  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  40 
 
 		 155 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 187 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  35.77 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  37.84 
 
 		 231 aa  90.5  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  34.51 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 184 aa  90.5  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  41 
 
 		 234 aa  90.5  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  33.55 
 
 		 157 aa  90.5  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 181 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 176 aa  90.1  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 142 aa  90.1  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 224 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.77 
 
 		 157 aa  89.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 200 aa  89.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  40 
 
 		 236 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  35.26 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  40 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  42.42 
 
 		 183 aa  89  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  40 
 
 		 236 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 178 aa  89  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  39.05 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 162 aa  89.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  40 
 
 		 236 aa  89.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  40 
 
 		 234 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  41.82 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  40 
 
 		 236 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 181 aa  89  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>