More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0862 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  100 
 
 		 166 aa  347  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 		 209 aa  168  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  49.44 
 
 		 172 aa  164  5.9999999999999996e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  45.26 
 
 		 188 aa  159  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  43.26 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  44.57 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  42.03 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  45.14 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  56.19 
 
 		 183 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  56.19 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  55.24 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  48 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  39.76 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  37.35 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  37.95 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  38 
 
 		 236 aa  106  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  38 
 
 		 234 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  37.43 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  37.95 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  38 
 
 		 234 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  38 
 
 		 234 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  38.69 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  38.15 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  32.26 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 236 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  38.92 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  44.72 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  34.64 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  35.75 
 
 		 177 aa  101  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  35.29 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  37.09 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  35.76 
 
 		 148 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 164 aa  99.8  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 167 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 220 aa  99  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  39.47 
 
 		 164 aa  97.8  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 152 aa  97.8  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  38.82 
 
 		 154 aa  97.8  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 242 aa  97.4  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  35.63 
 
 		 188 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 137 aa  97.4  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  42.4 
 
 		 163 aa  97.1  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 231 aa  97.1  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  39.83 
 
 		 222 aa  96.7  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  37.01 
 
 		 234 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 183 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  35.12 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 225 aa  95.9  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  40.16 
 
 		 178 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  31.52 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  39.34 
 
 		 231 aa  95.5  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  35.26 
 
 		 190 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  36.14 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 180 aa  94.7  5e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 181 aa  94.7  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 143 aa  94.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 146 aa  94  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  34.73 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 176 aa  94  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  30.39 
 
 		 176 aa  94  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 167 aa  94  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  34.13 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 163 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 161 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 196 aa  93.2  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  38.74 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  40.52 
 
 		 139 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  38.74 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 236 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  31.84 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 182 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 178 aa  92  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  42.31 
 
 		 177 aa  92  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 154 aa  92.4  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>