More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1661 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 172 aa  357  6e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  49.47 
 
 		 188 aa  187  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  53.72 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  53.37 
 
 		 161 aa  186  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  51.41 
 
 		 175 aa  181  5.0000000000000004e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  64.22 
 
 		 183 aa  168  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  64.22 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  45.9 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  48.62 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  53.29 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  63.21 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  47.37 
 
 		 176 aa  117  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  40.77 
 
 		 142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.28 
 
 		 163 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  37.22 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  49.53 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  38.95 
 
 		 149 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  46.49 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 161 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 163 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  37.21 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  40 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.97 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  99.4  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 156 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  43.31 
 
 		 166 aa  98.2  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  35.09 
 
 		 152 aa  98.2  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  38.37 
 
 		 154 aa  98.2  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 151 aa  97.4  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  35.47 
 
 		 159 aa  97.4  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  36.63 
 
 		 158 aa  97.4  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 151 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  36.93 
 
 		 168 aa  95.9  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  33.14 
 
 		 173 aa  96.7  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  33.15 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 146 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 167 aa  95.5  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 178 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 154 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  40.3 
 
 		 143 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 147 aa  95.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 175 aa  95.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  34.88 
 
 		 159 aa  94.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  36.93 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  46.36 
 
 		 242 aa  94.7  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  40.16 
 
 		 171 aa  94.7  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 222 aa  94.4  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 161 aa  94  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 230 aa  93.6  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  32.75 
 
 		 157 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  38.07 
 
 		 180 aa  93.2  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  37.79 
 
 		 163 aa  94  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  41.38 
 
 		 231 aa  93.6  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  41.8 
 
 		 238 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  40.3 
 
 		 180 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  38.29 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 200 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 234 aa  92.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  38.51 
 
 		 222 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  47.12 
 
 		 155 aa  92.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 146 aa  92  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  42.48 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  46.6 
 
 		 196 aa  92.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 220 aa  92.4  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 178 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  34.31 
 
 		 201 aa  91.3  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 185 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 196 aa  91.3  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 179 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 164 aa  90.9  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 		 184 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  32.75 
 
 		 166 aa  90.9  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 188 aa  90.9  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  35.43 
 
 		 165 aa  90.9  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 		 181 aa  90.9  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  45.05 
 
 		 183 aa  90.9  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 168 aa  90.9  9e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  36.75 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 236 aa  90.5  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 236 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  45.79 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>