More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1677 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  100 
 
 		 168 aa  343  4e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  49.54 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  42.19 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  46.49 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  38.83 
 
 		 188 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  41.41 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  49.52 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  38.67 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  42.4 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  44.76 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 		 183 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  38.12 
 
 		 182 aa  99.8  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  40.94 
 
 		 141 aa  99  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  35.26 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 141 aa  97.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  39.34 
 
 		 159 aa  97.4  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  43.38 
 
 		 206 aa  96.7  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  37.06 
 
 		 209 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  40.98 
 
 		 152 aa  95.5  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  36.16 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  36.16 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  36.16 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 141 aa  94.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  36.16 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  36.16 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  36.16 
 
 		 173 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  43.08 
 
 		 166 aa  94.7  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 175 aa  94.7  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 172 aa  94.4  6e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  37.95 
 
 		 163 aa  94.4  7e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 170 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  39.29 
 
 		 136 aa  94.4  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  36.21 
 
 		 169 aa  94  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  41.74 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  36.16 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  35.09 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  43.44 
 
 		 150 aa  93.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 172 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  33.53 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  35.59 
 
 		 173 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 141 aa  92.4  2e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  35.84 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  39.82 
 
 		 165 aa  91.3  5e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 150 aa  91.3  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  31.95 
 
 		 172 aa  91.3  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  35.17 
 
 		 146 aa  90.9  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  46.46 
 
 		 134 aa  90.9  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.49 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  45.63 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  35.75 
 
 		 175 aa  90.5  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  35.71 
 
 		 164 aa  90.5  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  34.3 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0180  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 131 aa  89.4  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  34.13 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 161 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 137 aa  89  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  34.5 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  36.72 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 224 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 143 aa  88.6  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 188 aa  88.2  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  31.01 
 
 		 139 aa  88.2  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 143 aa  88.2  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  37.3 
 
 		 161 aa  87.8  6e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  35.29 
 
 		 172 aa  87.8  7e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 192 aa  87.8  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 146 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  36.61 
 
 		 139 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 175 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  36.72 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  33.53 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  43.69 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  38.52 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  35.71 
 
 		 139 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 157 aa  85.9  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  34.09 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 146 aa  85.5  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  32.54 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  37.4 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  34.83 
 
 		 177 aa  85.1  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  38.79 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  38.79 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1821  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 130 aa  85.1  4e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 147 aa  84.7  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 130 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 130 aa  84.7  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 148 aa  85.1  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>