More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2288 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  100 
 
 		 159 aa  325  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  52.03 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  52.5 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  37.65 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  43.7 
 
 		 166 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  49.53 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  51.85 
 
 		 188 aa  111  5e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 161 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.12 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  49.09 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  42.31 
 
 		 206 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  44.86 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  40.51 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  46.3 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  37.95 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  33.92 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 182 aa  101  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  36.97 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 183 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 182 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  39.04 
 
 		 146 aa  101  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  46.09 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  44.34 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  32.75 
 
 		 164 aa  100  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  35.44 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  40.54 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  36.57 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  34.88 
 
 		 171 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  36.08 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  35.62 
 
 		 157 aa  96.3  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  35.4 
 
 		 147 aa  96.7  1e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.56 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  38.41 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  33.75 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 166 aa  94.4  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  45.45 
 
 		 150 aa  94  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 138 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  41.03 
 
 		 165 aa  93.2  1e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  34.76 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  34.57 
 
 		 143 aa  93.6  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.77 
 
 		 161 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 151 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  34.36 
 
 		 150 aa  91.7  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  40 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  35.62 
 
 		 156 aa  90.9  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  40.71 
 
 		 192 aa  90.9  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  33.95 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  37.11 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  37.11 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 186 aa  90.1  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  34.39 
 
 		 136 aa  90.1  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0023  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.0000000813945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 156 aa  89.4  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  38.53 
 
 		 169 aa  89.4  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  32.24 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  42.98 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  34.38 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 146 aa  89.7  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  35.12 
 
 		 164 aa  89  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 224 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  35.51 
 
 		 242 aa  88.2  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  38.4 
 
 		 236 aa  87.4  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  38.4 
 
 		 234 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  38.4 
 
 		 234 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  38.4 
 
 		 234 aa  87.4  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  38.4 
 
 		 236 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 146 aa  86.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  38.21 
 
 		 129 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 167 aa  87  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 		 171 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  31.87 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  37.27 
 
 		 139 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 220 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 175 aa  85.5  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  42.48 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  35.43 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 171 aa  85.5  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  40.71 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  40.71 
 
 		 177 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  35.12 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 139 aa  85.1  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>