More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1214 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
182 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  99.45 
 
 
182 aa  377  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  96.72 
 
 
183 aa  328  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  69.4 
 
 
175 aa  233  8e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  60.33 
 
 
209 aa  209  1e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  57.22 
 
 
188 aa  204  4e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  56.59 
 
 
175 aa  201  5e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  53.85 
 
 
206 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  53.51 
 
 
161 aa  185  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  64.22 
 
 
172 aa  166  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  52.17 
 
 
166 aa  145  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  42.15 
 
 
176 aa  109  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  43.81 
 
 
142 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 
177 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  44.86 
 
 
159 aa  102  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  39.23 
 
 
166 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  42.73 
 
 
184 aa  100  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  41.27 
 
 
151 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  48.57 
 
 
167 aa  99  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  43.93 
 
 
151 aa  99  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  36.6 
 
 
168 aa  98.2  6e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  45.79 
 
 
137 aa  97.8  8e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  44.86 
 
 
188 aa  97.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
199 aa  97.4  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
192 aa  97.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
192 aa  97.4  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
196 aa  97.4  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  46.23 
 
 
157 aa  97.4  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
184 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
179 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  42.4 
 
 
130 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  35.14 
 
 
148 aa  96.7  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 
177 aa  96.3  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 
179 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  47.62 
 
 
160 aa  96.3  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  37.69 
 
 
146 aa  95.9  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  43.81 
 
 
173 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  45.95 
 
 
190 aa  95.5  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 
182 aa  95.5  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 
178 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 
177 aa  95.5  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 
183 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 
186 aa  95.5  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  47.12 
 
 
181 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  44.55 
 
 
149 aa  95.1  4e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  46.15 
 
 
184 aa  95.5  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  41.35 
 
 
149 aa  94.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  43.4 
 
 
156 aa  94.7  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 
184 aa  94.4  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 
186 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  41.6 
 
 
130 aa  94.4  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 
187 aa  94.4  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  38.31 
 
 
154 aa  94  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  34.93 
 
 
146 aa  94  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  44.14 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  42.86 
 
 
163 aa  92.8  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  41.9 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  42.06 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  42.86 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  42.06 
 
 
163 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  41.9 
 
 
155 aa  93.2  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  44.86 
 
 
187 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  42.06 
 
 
161 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  41.35 
 
 
147 aa  92.4  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  38.58 
 
 
152 aa  92.4  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  44.86 
 
 
184 aa  92.4  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  43.22 
 
 
178 aa  92.4  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  37.61 
 
 
171 aa  92  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  43.81 
 
 
181 aa  92  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  43.22 
 
 
171 aa  92  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  45.71 
 
 
181 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  43.27 
 
 
230 aa  91.3  6e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  44.76 
 
 
181 aa  91.3  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  42.99 
 
 
162 aa  91.3  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  38.6 
 
 
164 aa  91.3  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  42.06 
 
 
156 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  45.37 
 
 
188 aa  90.9  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  42.62 
 
 
219 aa  90.9  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  45.71 
 
 
154 aa  90.9  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  37.21 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0277  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  43.24 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0304  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  38.84 
 
 
222 aa  90.5  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  43.27 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  37.96 
 
 
166 aa  90.1  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  38.05 
 
 
164 aa  89  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 
176 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  38.17 
 
 
175 aa  89  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  44.04 
 
 
176 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>