More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0828 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  100 
 
 		 176 aa  362  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  81.36 
 
 		 175 aa  302  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  63.64 
 
 		 175 aa  213  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  71.54 
 
 		 192 aa  185  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  69.72 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  64.35 
 
 		 151 aa  159  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  50.66 
 
 		 172 aa  157  6e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  60.98 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 157 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  46.33 
 
 		 166 aa  154  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  48.31 
 
 		 165 aa  154  6e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  58.26 
 
 		 138 aa  154  7e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 171 aa  149  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  60.55 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  58.72 
 
 		 163 aa  144  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  52.27 
 
 		 147 aa  137  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  57.8 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  43.6 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 234 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 234 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 234 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  44.3 
 
 		 236 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  43.5 
 
 		 173 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  43.62 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 242 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  54.87 
 
 		 154 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  39.01 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  42.77 
 
 		 152 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 231 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 220 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  41.86 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  47.2 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 225 aa  124  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  51.38 
 
 		 172 aa  124  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 236 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  53.47 
 
 		 234 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 235 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 231 aa  121  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  54.46 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  54.72 
 
 		 169 aa  121  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  39.08 
 
 		 161 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  53.7 
 
 		 148 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  53.7 
 
 		 146 aa  120  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  41.78 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  40.82 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  47.93 
 
 		 135 aa  120  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  50 
 
 		 155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  51.82 
 
 		 188 aa  118  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  50 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  53.77 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 		 135 aa  119  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  39.2 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 143 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  51.89 
 
 		 149 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  41.1 
 
 		 158 aa  118  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  50.49 
 
 		 201 aa  117  7.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  39.46 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  52.29 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  38.07 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  41.57 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  50 
 
 		 160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  51.96 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  49.56 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  51.92 
 
 		 178 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 156 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 156 aa  115  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  52.43 
 
 		 233 aa  114  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 		 182 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  48.7 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  47.71 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  51.46 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  51.46 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5215  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656478  normal  0.693787 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  51.46 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 222 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1550  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.202411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  49.04 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  39.24 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  50.86 
 
 		 130 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  51.43 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  49.51 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  38.76 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  40.6 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  51.96 
 
 		 180 aa  111  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  47.22 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>