More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0450 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  100 
 
 		 152 aa  309  9e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  51.47 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  41.74 
 
 		 206 aa  97.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  33.55 
 
 		 157 aa  90.1  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 168 aa  89.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  36.18 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.38 
 
 		 188 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  37.07 
 
 		 166 aa  86.3  1e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  36.94 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  43.24 
 
 		 209 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  36.94 
 
 		 182 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 183 aa  84.7  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0044  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.04 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  37.1 
 
 		 190 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  39.64 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  39.05 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  30.32 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  32.05 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  32.68 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  36.97 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  36.45 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  33.12 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  32.24 
 
 		 148 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  30.52 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1777  single-strand binding protein  32.7 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000276416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1863  prophage LambdaSa2, single-strand binding protein  32.24 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.108615  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  30.26 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  37.14 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  37.14 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  36.43 
 
 		 152 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  34.48 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  30.08 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  30.26 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  31.45 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 187 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  27.88 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000006762  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 199 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 184 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 192 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  33.65 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 192 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 196 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  30.26 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  30.07 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.21 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  33.04 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000326316  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 185 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  34.97 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  30.52 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  32.85 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  34.06 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000810976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  27.85 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  33.03 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  26.32 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  34.4 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000321111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  31.25 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  33.07 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  33.07 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  33.07 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  33.07 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  34.29 
 
 		 172 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  28.29 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000779972  normal  0.680564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>