More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0674 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  100 
 
 		 136 aa  277  3e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  60.56 
 
 		 133 aa  167  5e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 171 aa  115  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  49.53 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 141 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  46.34 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  50.48 
 
 		 148 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  39.04 
 
 		 156 aa  97.1  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  46.09 
 
 		 154 aa  95.9  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  40.14 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 137 aa  94  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 148 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  41.61 
 
 		 161 aa  90.5  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  35.06 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  40.29 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  35.66 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0813  single-strand binding protein  38.84 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2873  single-strand binding protein  38.84 
 
 		 125 aa  85.9  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0872221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  36.96 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  44.14 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  39.17 
 
 		 175 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 169 aa  84  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 172 aa  84  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 172 aa  84  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 167 aa  84  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  37.59 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  38.24 
 
 		 137 aa  84  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 164 aa  83.6  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  36.57 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 172 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  39.64 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  40.14 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  41.75 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  41.35 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  36.03 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  41.12 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  36.88 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  37.31 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  37.31 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 160 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  39.84 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.44 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.44 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  41.49 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 173 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  45.1 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  45 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  43.88 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  43.56 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0011  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000915981  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  40.38 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  39.64 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  44 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  42.16 
 
 		 224 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  35.1 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  40.21 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  41.35 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 222 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  36.13 
 
 		 172 aa  77  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 160 aa  77  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  39.05 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  43 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>