More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0637 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  100 
 
 
133 aa  268  2e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  60.56 
 
 
136 aa  167  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  50.72 
 
 
141 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  48.55 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  47.06 
 
 
171 aa  121  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  51.4 
 
 
148 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  47.76 
 
 
133 aa  106  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  49.12 
 
 
146 aa  103  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  45.69 
 
 
156 aa  102  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  43.75 
 
 
150 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  46.96 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  49.02 
 
 
154 aa  97.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  43.1 
 
 
174 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  44.23 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  40.3 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  40 
 
 
142 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  43.64 
 
 
180 aa  94  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  40.3 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  39.71 
 
 
139 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  46.23 
 
 
136 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  41.44 
 
 
166 aa  92  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  39.09 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  39.09 
 
 
150 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  42.73 
 
 
176 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  43.4 
 
 
140 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  46.67 
 
 
164 aa  90.5  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  37.96 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  45.28 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  40.54 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  38.85 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  39.82 
 
 
168 aa  89  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  44.95 
 
 
150 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  42.99 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  43.69 
 
 
167 aa  89  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  42.99 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  39.09 
 
 
160 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  38.3 
 
 
142 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000253861  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  46.15 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  42.99 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  46.6 
 
 
184 aa  88.6  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  42.99 
 
 
156 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  46.15 
 
 
142 aa  89.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  42.57 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  40.91 
 
 
150 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  45.19 
 
 
169 aa  87.8  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  44.76 
 
 
164 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  45.63 
 
 
148 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223705  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  45.19 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  45.19 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  41.12 
 
 
222 aa  87  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
173 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 
169 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
173 aa  86.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
173 aa  86.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
173 aa  86.7  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  35.51 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.38 
 
 
173 aa  86.3  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2190  single-strand binding protein  38.46 
 
 
129 aa  86.3  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  37.5 
 
 
139 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
173 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0422  single-strand binding protein  39.29 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.185373  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  44.12 
 
 
172 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  35.29 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3289  single-strand binding protein  43.14 
 
 
119 aa  84.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  38.21 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  39.42 
 
 
183 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  34.23 
 
 
157 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  34.59 
 
 
137 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  42.72 
 
 
224 aa  84.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  35.94 
 
 
175 aa  83.6  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  34.56 
 
 
139 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2987  single-strand binding protein  38.89 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00344434  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  38.32 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.59 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  42.45 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  40.95 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  39.42 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  40 
 
 
123 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  33.82 
 
 
188 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  34.81 
 
 
175 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  35.96 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  39.62 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  33.04 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  38.1 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  41.75 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3137  single-strand binding protein  39.62 
 
 
114 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.560759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  37.38 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  37.5 
 
 
169 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  38.1 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.04 
 
 
159 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  36.52 
 
 
209 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  39.25 
 
 
167 aa  80.5  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  39.47 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.04 
 
 
159 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>