More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0559 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  100 
 
 		 171 aa  347  4e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 133 aa  121  6e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  44.64 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0332  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000125233  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 141 aa  101  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  43.24 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  47.62 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  44.83 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  37.58 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  49.04 
 
 		 161 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  37.78 
 
 		 142 aa  92.4  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  40.52 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 150 aa  90.5  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 156 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  45.71 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 138 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  36.59 
 
 		 161 aa  88.6  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  37.9 
 
 		 172 aa  88.2  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 139 aa  88.2  5e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 166 aa  87.8  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  36.42 
 
 		 164 aa  87.4  9e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  40.8 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  43.81 
 
 		 136 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  41.82 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 180 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  40.68 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  36.42 
 
 		 164 aa  85.5  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 156 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  38.52 
 
 		 165 aa  85.1  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 137 aa  85.1  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  36.97 
 
 		 176 aa  85.1  4e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  40.91 
 
 		 120 aa  85.1  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  37.8 
 
 		 175 aa  84.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  40 
 
 		 146 aa  84.7  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  35.57 
 
 		 164 aa  84.3  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 181 aa  84.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 186 aa  84  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  43.14 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000767815  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0651  single-strand binding protein  36.3 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.136208  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  40.78 
 
 		 168 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  38.84 
 
 		 181 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  37.01 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  39.45 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  36.3 
 
 		 146 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  41.28 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  33.71 
 
 		 169 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  33.71 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1869  single-strand binding protein  38.53 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  39.82 
 
 		 165 aa  81.6  0.000000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0425  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000015552  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0414  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000719074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  39.45 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0880  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717763  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  36.94 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0864  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 173 aa  81.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  43.27 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  36.52 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  34.43 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4718  single-stranded DNA-binding protein  36.89 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.336644 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  42 
 
 		 176 aa  80.5  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>