More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0301 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 120 aa  244  2e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  60.66 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  60.66 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  68.52 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  68.52 
 
 		 129 aa  160  8.000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  67.89 
 
 		 128 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  62.07 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  65.09 
 
 		 123 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  65.74 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  60.5 
 
 		 120 aa  154  4e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  65.09 
 
 		 124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  66.97 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  64.86 
 
 		 125 aa  153  8e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  64.15 
 
 		 133 aa  152  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 123 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  55.46 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  62.04 
 
 		 123 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  63.55 
 
 		 121 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  43.59 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  39.34 
 
 		 171 aa  95.5  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 127 aa  93.2  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 170 aa  89  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0559  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 171 aa  85.1  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.401041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 146 aa  84.7  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 149 aa  84.3  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  37.96 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  32.23 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  36.44 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  37.14 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  34.45 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  36.36 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 139 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  32.73 
 
 		 156 aa  80.1  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  36.19 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  33.87 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  34.51 
 
 		 115 aa  80.1  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  36.21 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  33.93 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  35.51 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  35.48 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  38.14 
 
 		 176 aa  77.8  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  34.62 
 
 		 224 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  37.78 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  34.92 
 
 		 188 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  34.19 
 
 		 174 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  39.62 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  32.76 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  35.45 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0379  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.806317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  32.5 
 
 		 175 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  36.52 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  33.06 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  34.17 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  36.79 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  36.21 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  37.84 
 
 		 163 aa  74.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  36.19 
 
 		 182 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  35.83 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  35.83 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  33.93 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  32.41 
 
 		 156 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0314  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  31.71 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  35.29 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  41.74 
 
 		 147 aa  73.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  33.61 
 
 		 152 aa  73.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3728  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 167 aa  73.2  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0825596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  32.12 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>