More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_18121 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
123 aa  249  9.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  93.4 
 
 
133 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  86.18 
 
 
123 aa  202  8e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  92.45 
 
 
124 aa  201  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  73.64 
 
 
127 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  71.32 
 
 
129 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  71.32 
 
 
129 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  66.4 
 
 
125 aa  177  4e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  71.17 
 
 
128 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  65.6 
 
 
125 aa  175  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 
120 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  56.91 
 
 
123 aa  147  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  55.56 
 
 
119 aa  146  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  60.55 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  60.55 
 
 
122 aa  145  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  55.56 
 
 
121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  55.05 
 
 
120 aa  133  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  53.21 
 
 
120 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  50.43 
 
 
135 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  46.79 
 
 
127 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  40 
 
 
115 aa  93.2  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  34.21 
 
 
242 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  36.79 
 
 
156 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  35.19 
 
 
220 aa  84.3  5e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  35.19 
 
 
231 aa  84  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  34.26 
 
 
225 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  35.85 
 
 
163 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  35.85 
 
 
161 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  35.85 
 
 
161 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  33.59 
 
 
138 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  34.69 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  34.23 
 
 
120 aa  80.5  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  35.19 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  32.46 
 
 
161 aa  77.8  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  33.87 
 
 
176 aa  77  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  35.24 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  32.41 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  33.02 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  35.24 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  31.67 
 
 
166 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  39.08 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  31.48 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  35 
 
 
206 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  44.05 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  32.38 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  32.73 
 
 
161 aa  74.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  32.73 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1081  single-stranded DNA-binding protein  35.45 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000301398  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  33.03 
 
 
188 aa  74.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  33.07 
 
 
165 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  35.24 
 
 
170 aa  74.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  32.08 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  41.44 
 
 
172 aa  73.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  31.45 
 
 
222 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  31.2 
 
 
176 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  28.85 
 
 
224 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  31.48 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  36.84 
 
 
156 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  35.64 
 
 
234 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  36.75 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  33.33 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  32.71 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  33.03 
 
 
175 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  29.92 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  35.85 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  33.33 
 
 
164 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4370  single-strand binding protein  35.19 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  34.91 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  30.7 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  33.33 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1694  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  32.74 
 
 
238 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  28.93 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  32.74 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  32.41 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  31.82 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  32.74 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  35.71 
 
 
164 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  32.74 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  32.74 
 
 
234 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  32.74 
 
 
236 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  30 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  34.92 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  33.65 
 
 
177 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  30.91 
 
 
180 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  34.62 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  34.71 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  30.6 
 
 
133 aa  72  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  30.3 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  36.17 
 
 
176 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  31.82 
 
 
171 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  32.08 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  29.41 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  33.02 
 
 
169 aa  71.2  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1713  single-stranded DNA-binding protein  38.68 
 
 
163 aa  70.9  0.000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000713514  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  33.33 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  39.62 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>