More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1149 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 
119 aa  245  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  69.64 
 
 
120 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  68.1 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  68.1 
 
 
122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  68.1 
 
 
123 aa  170  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  71.56 
 
 
120 aa  167  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  72.9 
 
 
121 aa  167  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  68.81 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  68.81 
 
 
129 aa  163  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  68.47 
 
 
128 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  66.07 
 
 
125 aa  158  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  64.29 
 
 
125 aa  155  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  64.49 
 
 
127 aa  154  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  66.97 
 
 
120 aa  153  7e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  60.75 
 
 
123 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  60.75 
 
 
124 aa  147  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  59.81 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  58.72 
 
 
123 aa  143  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  52.83 
 
 
135 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  46.55 
 
 
127 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  41.32 
 
 
149 aa  92  3e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  37.5 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  39.47 
 
 
206 aa  88.2  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  42.28 
 
 
209 aa  87.4  6e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  35.4 
 
 
115 aa  84.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  40.18 
 
 
183 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  42.99 
 
 
175 aa  84  6e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  40.18 
 
 
182 aa  83.6  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  40.18 
 
 
182 aa  83.6  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  39.09 
 
 
176 aa  83.6  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  38.32 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  33.33 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  35.19 
 
 
220 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  34.26 
 
 
231 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  42.06 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  35.19 
 
 
225 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  34.68 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  37.84 
 
 
120 aa  80.9  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  37.07 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  37.14 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  37.9 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  39.42 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.17 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  36.79 
 
 
170 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  38.74 
 
 
174 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  40.95 
 
 
188 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  36.52 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.61 
 
 
149 aa  77  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  35.04 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  35.71 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  37.89 
 
 
163 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.85 
 
 
164 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  37.89 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1321  single-strand binding protein  33.33 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443248  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2281  single-strand binding protein  33.33 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  37.89 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  35.04 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1705  single-strand binding protein  33.33 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.17313e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  39.25 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  39.29 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  37.89 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  37.5 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  39.29 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  36.45 
 
 
169 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  39.29 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  38.64 
 
 
146 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  40.57 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  34.86 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  35.45 
 
 
176 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  35.78 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  39.08 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  45.21 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  32.17 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  36.84 
 
 
166 aa  72  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  33.94 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  35.85 
 
 
200 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  31.4 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  36.04 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  33.94 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  36.67 
 
 
172 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  32.73 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  33.63 
 
 
176 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  36.27 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.75 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.64 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  33.33 
 
 
172 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  36.19 
 
 
196 aa  70.9  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  35.24 
 
 
180 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  34.48 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  33.64 
 
 
172 aa  70.1  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  33.91 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0271  single-stranded binding protein  38.54 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  33.94 
 
 
157 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  33.91 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  35.85 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  33.02 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  30.56 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  33.02 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  33.94 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  38.83 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>