More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1200 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 129 aa  263  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  100 
 
 		 129 aa  263  7e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  82.17 
 
 		 128 aa  213  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  76.74 
 
 		 125 aa  203  7e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  75.19 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  75.97 
 
 		 125 aa  200  4e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  81.13 
 
 		 123 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  80.19 
 
 		 124 aa  186  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  79.25 
 
 		 133 aa  185  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  75.93 
 
 		 123 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  64.96 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  67.89 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  67.89 
 
 		 122 aa  161  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  68.52 
 
 		 120 aa  160  6e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  63.33 
 
 		 120 aa  157  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  58.54 
 
 		 123 aa  156  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  60.83 
 
 		 120 aa  153  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  65.42 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  44.63 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  51.46 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  38.05 
 
 		 115 aa  94.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  44.34 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  36.64 
 
 		 206 aa  89.4  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 161 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 163 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  38.68 
 
 		 161 aa  88.2  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10587  predicted protein  41.67 
 
 		 120 aa  87  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0851904  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  39.09 
 
 		 176 aa  86.3  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0484  single-strand binding protein  34.35 
 
 		 176 aa  85.5  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 231 aa  84  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  36.7 
 
 		 225 aa  84  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  32.03 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  35.58 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  35.34 
 
 		 164 aa  84  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  34.86 
 
 		 220 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  32.54 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  36.13 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  33.6 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  31.21 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  33.59 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  30.94 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  33.1 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  31.88 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  30.56 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  30.38 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0166  single-strand binding protein  32 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000052118  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  32.82 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  37.74 
 
 		 147 aa  78.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  33.87 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 166 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0008  single-stranded DNA-binding protein  39.2 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000612973  hitchhiker  0.0000000000172856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  31.16 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  29.25 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  35.78 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  34.58 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  28.28 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  30.34 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  31.58 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  37.14 
 
 		 188 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  31.75 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  36.79 
 
 		 170 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  32.52 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  32.09 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  35.85 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  30.82 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  35.24 
 
 		 182 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  35.09 
 
 		 177 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  33.04 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  27.33 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  33.93 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  35.51 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  35.82 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000139016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  30.37 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  34.23 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  34.58 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2128  single-stranded DNA-binding protein  44.05 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  36.63 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 172 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  31.06 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  34.56 
 
 		 136 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  29.1 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  32.28 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>