More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5984 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  100 
 
 		 171 aa  347  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  50.29 
 
 		 170 aa  164  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  46.78 
 
 		 152 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  42.62 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  41.86 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  57.94 
 
 		 147 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  55.05 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  40.22 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  55.14 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  56.07 
 
 		 146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  42.44 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  41.3 
 
 		 184 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  41.76 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  52.34 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  42.61 
 
 		 174 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  52.34 
 
 		 149 aa  124  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  40.12 
 
 		 151 aa  121  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  39.41 
 
 		 172 aa  122  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 139 aa  121  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  40 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  50.46 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  40.85 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  36.69 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  36.7 
 
 		 190 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  42.03 
 
 		 139 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  43.06 
 
 		 238 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  50.91 
 
 		 151 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  42.03 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  37.21 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  39.38 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  36.99 
 
 		 168 aa  117  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  39.08 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  36.84 
 
 		 156 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.63 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  46.21 
 
 		 175 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  52.78 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  38.15 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  43.85 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 179 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  41.5 
 
 		 236 aa  114  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  49.07 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  41.5 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  41.5 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  35.96 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  47.27 
 
 		 156 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  40 
 
 		 163 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  41.5 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  45.69 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  36.26 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  40.82 
 
 		 236 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  39.08 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  37.91 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  41.57 
 
 		 182 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  40.83 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  48.15 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  39.78 
 
 		 176 aa  112  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  38.51 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  34.25 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  42.47 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0296  single-strand binding protein  50 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.170779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  50 
 
 		 187 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  46.3 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  44.92 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  50 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 230 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  38.8 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>