More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0130 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  100 
 
 		 142 aa  290  4e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  50.33 
 
 		 151 aa  153  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  51.39 
 
 		 136 aa  144  6e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  58.72 
 
 		 157 aa  140  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  53.85 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  44.59 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  55.45 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  56.07 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  42.03 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  51.4 
 
 		 167 aa  124  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 147 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  40.65 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 186 aa  122  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  39.38 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  40.69 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  55.14 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  53.7 
 
 		 170 aa  120  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  47.32 
 
 		 164 aa  120  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  51.79 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  51.4 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  48.6 
 
 		 164 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  52.34 
 
 		 166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 139 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  49.52 
 
 		 200 aa  117  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  50.45 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0271  single-stranded binding protein  42.58 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  48.53 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  50.93 
 
 		 160 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 173 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  50 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  41.94 
 
 		 167 aa  114  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  45.64 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  49.53 
 
 		 163 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  50 
 
 		 242 aa  114  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  39.24 
 
 		 158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  47.75 
 
 		 157 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  50 
 
 		 143 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  56.57 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  56.57 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  53.77 
 
 		 225 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  47.75 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  48.15 
 
 		 171 aa  112  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  40.43 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  50.94 
 
 		 220 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  44.62 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  57.58 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  38.61 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  45.38 
 
 		 181 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  48.09 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  56.57 
 
 		 176 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  48.25 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 180 aa  110  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  53.54 
 
 		 180 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 183 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  50 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 176 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  46.56 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 172 aa  110  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  41.35 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.22 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 231 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 219 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  54.08 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  38.07 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  46.3 
 
 		 213 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  48.15 
 
 		 181 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  44.54 
 
 		 222 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  52.04 
 
 		 236 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  54.55 
 
 		 182 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  50.96 
 
 		 178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  50.96 
 
 		 184 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  43.64 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 236 aa  108  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 234 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  52.04 
 
 		 235 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>