More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_C0119 on replicon NC_007412
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007412  Ava_C0119  single-strand binding protein  100 
 
 		 127 aa  264  4e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20751  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1200  single-stranded DNA-binding protein  48.11 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01781  single-stranded DNA-binding protein  44.95 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  50.96 
 
 		 120 aa  114  5e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  46.55 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17491  single-stranded DNA-binding protein  43.36 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.932532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0148  single-stranded DNA-binding protein  44.44 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0104  single-stranded DNA-binding protein  42.86 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18151  single-stranded DNA-binding protein  49.52 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.472056  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18331  single-stranded DNA-binding protein  49.5 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1716  single-stranded DNA-binding protein  48.57 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  50 
 
 		 121 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4131  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4171  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 122 aa  107  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000225771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18121  single-stranded DNA-binding protein  47.62 
 
 		 123 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  hitchhiker  0.00558651  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  40.18 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0301  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5420  single-strand binding protein  38.74 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  31.06 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  33.96 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  35.51 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  30.23 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  33.64 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  35.24 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  33.02 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  37.29 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2378  single-strand binding protein  36.04 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.14117e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16725  predicted protein  28.18 
 
 		 115 aa  73.9  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01895  Single-strand binding protein  41.86 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.326894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  31.3 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  39.25 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  32.28 
 
 		 165 aa  72.4  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  35.14 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  35.14 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03473  hypothetical protein  35.14 
 
 		 161 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  31.58 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  32.17 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  28.04 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0262  single-stranded DNA-binding protein  34.86 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  32.8 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0868  single-strand binding protein  36.54 
 
 		 108 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.585273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  32.74 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  29.91 
 
 		 225 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  32.8 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4599  single-stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4598  single-stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  34.55 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4650  single-stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  32.26 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  29.36 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4512  single-stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4504  single-stranded DNA-binding protein  35.92 
 
 		 176 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4713  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  29.84 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 180 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  30.7 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  33.86 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  30.91 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 236 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4565  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  31.43 
 
 		 188 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 238 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  31.82 
 
 		 236 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  34.65 
 
 		 180 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  29.5 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  32.52 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  33.96 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  33.94 
 
 		 182 aa  67.4  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 214 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  33.03 
 
 		 176 aa  67  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2617  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 224 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000158869  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  27.94 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  35.23 
 
 		 177 aa  67  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3411  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 181 aa  67  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0856708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  29.84 
 
 		 192 aa  67  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  29.36 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  31.53 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>