More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1527 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  100 
 
 		 152 aa  320  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  92.76 
 
 		 151 aa  293  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  57.23 
 
 		 166 aa  182  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  54.25 
 
 		 138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  62.4 
 
 		 192 aa  162  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  62.6 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  59.38 
 
 		 175 aa  156  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  60.98 
 
 		 176 aa  155  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  46.5 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  50.86 
 
 		 161 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  43.75 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  43.75 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  56.03 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  44.94 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  48.91 
 
 		 188 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  53.91 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  56.76 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  54.95 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  47.4 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  44.72 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  44.3 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  48.03 
 
 		 135 aa  130  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  56.88 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  48.91 
 
 		 165 aa  130  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  47.37 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  50.45 
 
 		 242 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  58.1 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  44.03 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  52.29 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  50.45 
 
 		 220 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  52.25 
 
 		 231 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  51.35 
 
 		 225 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  53.64 
 
 		 175 aa  126  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  43.12 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  45.27 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  44.59 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  40.24 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 231 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0056  single-stranded DNA-binding protein  41.48 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.564154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  54.21 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  44.74 
 
 		 146 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  40.26 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  46.49 
 
 		 222 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 200 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 236 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 238 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 222 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  51.92 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 234 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  51.33 
 
 		 236 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  43.9 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  41.25 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  56.19 
 
 		 169 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  43.71 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  47.2 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  50.91 
 
 		 236 aa  120  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  41.42 
 
 		 166 aa  120  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  43.9 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  50.96 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  50 
 
 		 234 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 185 aa  119  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  54.81 
 
 		 146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  47.17 
 
 		 196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  50.91 
 
 		 236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  50.91 
 
 		 235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  43.9 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  41.61 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  42.26 
 
 		 181 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  52.38 
 
 		 173 aa  118  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  46.83 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  40.7 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  55.66 
 
 		 183 aa  117  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  41.61 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  50.44 
 
 		 180 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  53.7 
 
 		 230 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  54.63 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  47.71 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  41.83 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3720  single-strand binding protein  43.92 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4323  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 214 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  46.03 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  42.77 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  38.04 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  39.26 
 
 		 165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  40.51 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  48.25 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  48.25 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  48.25 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  48.25 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  51.43 
 
 		 181 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  48.25 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  43.05 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  48.25 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>